Основы параллельного программирования на кластере и разработка элективного курса «Администрирование в информационных системах и администрирование виртуальных машин» (стр. 3 из 12)
Не забудьте только положить полученный исполняемый файл в /usr/sbin.
Если по каким то причинам вам нужно, чтобы все сетевые драйверы были загружены до загрузки bonding-драйвера, добавьте ниже приведенную строчку в файл /etc/modules.conf. Эта инструкция укажет системе, что в случае поднятия интерфейса bond0 утилита modprobe должна сначала загрузить драйверы для всех ваших сетевых интерфейсов.
probeallbond0 eth0 eth1 bonding
Собственно на этом настройка channel bonding закончена. Если сетевой интерфейс поднялся без ошибок, то проверить этот знаменательный факт можно используя обычную команду ifconfig. Запустив ее без параметров вы должны увидеть нечто подобное:
[root]# /sbin/ifconfig
bond0 Link encap:Ethernet HWaddr 00:C0:F0:1F:37:B4
inet addr:192.168.1.1 Bcast:192.168.1.255 Mask:255.255.255.0
UP BROADCAST RUNNING MASTER MULTICAST MTU:1500 Metric:1
RX packets:7224794 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
TX packets:3286647 errors:1 dropped:0 overruns:1 carrier:0
collisions:0 txqueuelen:0
eth0 Link encap:Ethernet HWaddr 00:C0:F0:1F:37:B4
inet addr:192.168.1.1 Bcast:192.168.1.255 Mask:255.255.255.0
UP BROADCAST RUNNING SLAVE MULTICAST MTU:1500 Metric:1
RX packets:3573025 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
TX packets:1643167 errors:1 dropped:0 overruns:1 carrier:0
collisions:0 txqueuelen:100
Interrupt:10 Base address:0x1080
eth1 Link encap:Ethernet HWaddr 00:C0:F0:1F:37:B4
inet addr:192.168.1.1 Bcast:192.168.1.255 Mask:255.255.255.0
UP BROADCAST RUNNING SLAVE MULTICAST MTU:1500 Metric:1
RX packets:3651769 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
TX packets:1643480 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0
collisions:0 txqueuelen:100
Interrupt:9 Base address:0x1400
lo Link encap:Local Loopback
inet addr:127.0.0.1 Mask:255.0.0.0
UP LOOPBACK RUNNING MTU:16436 Metric:1
RX packets:1110 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
TX packets:1110 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0
collisions:0 txqueuelen:0
Если вы увидели нечто подобное на экране монитора, можете себя поздравить, вы успешно сконфигурировали связанный канал. Как видите, ip- и MAC-адреса всех сетевых интерфейсов у нас получились одинаковыми. Чтобы switch мог нормально работать с таким каналом вам необходимо настроить Link Aggrigation. Как это делать вы можете прочитать в документации вашего коммутатора. Для разных моделей коммутатров и разных версий их программного обеспечения это может делаться по-разному. Поэтому в данной книге мы опустим вопросы настройки Link Aggrigation на коммутаторах.
В интернете встречаются сообщения, что в некоторых случаях, после поднятия виртуального сетевого интерфейса дополнительные каналы не могут сразу принимать входящие покеты. Это может произойти по причине того, что новый MAC-адрес дополнительных каналов не прописывается физически в EPROM сетевой карты, в результате чего при старте компьютера свитч не знает о том, что этот MAC-адрес присоединен к более чем одному порту. Для того, чтобы сообщить свитчу правильный набор MAC-адресов достаточно нпосредственно после поднятия интерфейса выполнить несколько пингов. После того, как ICMP-пакеты пройдут через коммутатор по всем виртуальным каналам, внутренняя таблица коммутатора примет правильный вид и в дальнейшем проблем с приемом пакетов не будет.
1.3 Устройство кластера
Кластер Beowulf состоит из отдельных машин (узлов) и объединяющей их сети (коммутатора). Кроме ОС, необходимо установить и настроить сетевые драйверы, компиляторы, ПО поддержки параллельного программирования и распределения вычислительной нагрузки.
Узлы кластера. Подходящим выбором в данный момент являются системы на базе процессоров Intel Pentium 4. Стоит установить на каждый узел не менее 64-128MB оперативной памяти. Одну из машин следует выделить в качестве центральной (консоль кластера) куда можно (но не обязательно) установить достаточно большой жесткий диск, возможно более мощный процессор и больше памяти, чем на остальные (рабочие) узлы. Делать консоль кластера более мощной машиной имеет смысл, если вы захотите иметь на этом компьютере кроме интерфеса командной строки более удобное операционной окружение, например оконый менеджер (KDE, Gnome), оффисные программы, программы визуализации данных и т.п..
Имеет смысл обеспечить (защищенную) связь этой машины с внешним миром. Другими словами, сеть кластера (сеть состоящая их консоли кластера и рабочих узлов) топологически не должна находится внутри корпоративной сети. Если необходимо обеспечить доступ к консоли кластера из корпоративной сети и/или Интернет, то в этом случае, связь должна идти через отдельную сетевую карту, установленную в главном компьютере, и отдельный коммутатор.
При комплектации рабочих узлов вполне возможно отказаться от жестких дисков - эти узлы будут загружать ОС через сеть с центральной машины, что, кроме экономии средств, позволяет сконфигурировать ОС и все необходимое ПО только один раз (на центральной машине). Если эти узлы не будут одновременно использоваться в качестве пользовательских рабочих мест, нет необходимости устанавливать на них видеокарты и мониторы. Возможна установка узлов в стойки (rackmounting), что позволит уменьшить место, занимаемое узлами, но будет стоить несколько дороже.
Возможна организация кластеров на базе уже существующих сетей рабочих станций, то есть рабочие станции пользователей могут использоваться в качестве узлов кластера ночью и в нерабочие дни. Системы такого типа называют COW (ClusterofWorkstations). В этом случае реальным представляется вариант, когда кластер строится на основе существующего компьютерного класса. Подобные классы уже имеются в большинстве учебных или научных учреждениях и обычно скомплектованы однотипными машинами, что и необходимо для кластера. Однако обычно такие компьютерные классы работают под операционной системой Windows и, вероятно, для замены ее на Unix придется решить вопросы административного плана и вопросы связанные с построением учебного процесса. Принципиальных препятствий для решения этих вопросов по-видимому нет, поскольку Unix (конкретно Linux) имеет все необходимое программное обеспечение для проведения учебного процесса или научной деятельности (компиляторы, средства разработки, офисные программы, программы работы с изображениями и визуализации данных, средства публикации (TeX)). Эта книга, например, большую часть времени писалась на консоли кластера в OpenOffice под управлением операционной системы Linux. Нельзя сказать, чтобы я испытывал при этом какую-либо ностальгию по старому доброму MS Word.
По большому счету отказываться от Windows не обязательно. Коммуникационные библиотеки PVM, MPI имеются не только для UNIX, но и для Windows. Если установка в компьютерном классе UNIX-сети вызывает непреодолимую аллергическую реакцию у админов или преподавателей, можно оставить ту операционную систему, к которой вы привыкли.
В принципе, для кластерных систем типа COW нет насущной необходимости останавливать кластер (и задачи на нем считаемые) на дневное (рабочее) время, когда за узловыми машинами работают пользователи. Работа параллельных программ конечно будет замедляться, но это не летально. Другое дело, если работа кластера будет заметно тормозить и затруднять работу пользователей.
Сеть. В простейшем случае для связи между узлами кластера используется один сегмент Ethernet (10Mbit/sec на витой паре). Однако дешевизна такой сети, вследствие коллизий оборачивается большими накладными расходами на межпроцессорные обмены, а хорошую производительность такого кластера можно ожидать только на задачах с очень простой параллельной структурой и при очень редких взаимодействиях между процессами (например, перебор вариантов).
Для получения хорошей производительности межпроцессорных обменов используют полнодуплексный Fast Ethernet на 100Mbit/sec или Gigabit Ethernet. При этом для уменьшения числа коллизий или устанавливают несколько "параллельных" сегментов Ethernet, или соединяют узлы кластера через коммутатор (switch). Под "параллельными" сегментами подразумевается такая структура сети, когда каждый узел кластера имеет более одной сетевой карты, которые с помощью специальных драйверов объединяются в один виртуальный сетевой интерфейс, имеющий суммарную пропускную способность. Для того, чтобы избежать проблем с конфигурированием такого виртуального интерфеса, следует использовать одинаковые сетевые карты на всех машинах кластера. Кроме того, каждая параллельная линия такого интерфеса должна представлять из себя Ethernet-сеть построенную на отдельном (от других параллельных ей линий) комутаторе.
1.4 ОПЕРАЦИОНАЯ СИСТЕМА
При выборе операционной системы следует основываться прежде всего на рекомендациях разработчиков программного обеспечения. Однако, если есть выбор, то при прочих равных условиях следует отдать предпочтение Linux.
Под Linux доступно огромное количество серверного ПО, компиляторов, библиотек, средств отладки и пр. Большое количество программного обеспечения имеется в свободном доступе, для многих программ есть исходные коды и обширная документация.
Плюсом Linux является "прозрачность" для пользователя и системного администратора, что позволяет быстрее и проще разрешать все возникающие проблемы.
Однако зацикливаться на выборе операционной системы не надо. Поскольку вы являетесь не системным администратором, а научным работником, операционная система для вас значит не больше, чем офис для бизнесмена. Основными вашими инструментами являются карандаш, бумага и транслятор с вашего любимого языка программирования. Кластерный суперкомпьютер есть не цель, но всего лишь средство для усовершенствования и оптимизации вашей основной работы.
Основой кластера является не операционная система, а коммуникационная среда (PVM, MPI), обеспечивающая возможность частям параллельной программы, выполняющимся на разных компьютерах, эффективно взаимодействовать между собой.
Рассмотренные ранее средства для построения кластера (PVM, MPI) имеют реализации как для операционных систем семейства UNIX (Linux, FreeBSD и т.п.), так и для систем фирмы Майкрософт. Поэтому, если вы испытываете непреодолимые трудности в отказе от Windows, то расстраиваться по этому поводу не надо. Кластер можно поднять и под Windows, причем трудозатраты на установку коммуникационной среды будут такими же как и в варианте с UNIX, то есть небольшими. Основная ваша трудность будет заключаться в том, чтобы научиться писать параллельные программы.