28 ноября 1960 года в Башкирском государственном краеведческом музее проводится семинар - совещание работников краеведческих музеев Автономных республик и областных музеев Российской Федерации. Проведение этого семинара в Уфе на базе музея явилось признанием авторитета сотрудников и нашего музея перед музейными работниками России.
25 декабря 1964 года представители партийных, советских и общественных организаций г. Уфы собрались на 100-летний юбилей музея. За долголетнюю, безупречную работу в музее пять сотрудников были награждены Почетными Грамотами Президиума Верховного Совета Башкирской АССР. Это было признанием государства труда музейных работников республики.
В 1970-80 годы в Башкортостане строится ряд музеев, которые становятся филиалами Республиканского краеведческого музея и в целях совершенствования руководства музеями 11 ноября 1984 года Республиканский краеведческий музей реорганизуется в Башкирский государственный объединенный музей, в состав которого входят 14 филиалов.
В 1993 году наступает новый этап в жизни объединения - согласно Постановлению Совета Министров Республики Башкортостан от 20 января Башкирский государственный объединенный музей был реорганизован в Национальный музей Республики Башкортостан, в состав которого, кроме 34 филиалов, вошли музейный историко-культурный комплекс и Музей интернациональной дружбы.
В декабре 1989 года музею передают здание бывшего обкома ВЛКСМ и Президиума Верховного Совета Башкирской АССР по улице Советской, 14. Однако из-за отсутствия достаточного финансирования ремонтные и экспозиционные работы велись медленно.
16 октября 2001 года Президент Республика Башкортостан М.Г. Рахимов подписал Указ №УП-492 "О Национальном музее Республики Башкортостан", где были указаны сроки проведения ремонтных и реставрационных работ здания музея.
17 июня 2004 года обновленный Национальный музей в присутствии Президента Республики Башкортостан М.Г. Рахимова и других официальных лиц был торжественно открыт.
Сегодня в музее работает 34 экспозиционных и выставочных зала, в которых размещены экспонаты различной тематики, начиная с природы родного края, истории, археологии, этнографии, в которых широко представлено богатое прошлое и настоящее Республики Башкортостан.
С 2001 по 2004 гг., согласно Указу Президента Республики Башкортостан, в здании музея проходил капитальный ремонт и реставрация. Одновременно коллективом научных сотрудников была разработана и построена новая экспозиция, основанная на новейших разработках экспозиционного и дизайнерского искусства.
Грамоты и медали, врученные Национальному музею Республики Башкортостан.
В 1887 году музей участвует в Сибирско-Уральской выставке и за работу по этнографии получает серебреную медаль.
В 1893 году музей экспонирует выставку на сельскохозяйственную тему в Чикаго (США) и получает бронзовую медаль, экспонаты выставки были оставлены в Чикаго и подарены местному музею.
В 1897 году музей участвует в Урало-Сибирской выставке с этнографической коллекцией и получает серебреную медаль.
В 1910 году музей экспонирует свою нумизматическую коллекцию в г. Казани и получает Похвальную грамоту от Императорской семьи.
Задача Национального музея Республики Башкортостан - дать такой объем информации о нашем крае, чтобы всем посетителям было интересно и комфортно в стенах "храма" истории и культуры. Музей дает возможность посетителям проследить хронику исторических событий с древнейших времен до современности.
Фонд "Археология".
Археологическая коллекция отражает определенный этап в развитии древних археологических культур: каменный век, эпоха бронзы, эпоха железа, эпоха средневековья. В коллекции, находящейся в основном фонде археологии Национального музея Республики Башкортостан, содержатся разнообразные вещи и предметы. Прежде всего, это керамика, включающая в себя по различному орнаментированные, а также неорнаментированные стенки, венчики и днища разных сосудов (горшки и горшочки, чаши, пиалы и т.д.) изделия из камня, кремния, яшмы, бронзы, железа, пасты и стекла, кости, раковин, некоторых других материалов. Среди каменных изделий следует отметить скребки, нуклеусы, тёрочники, точила, рубила, оселки, зубила, отбойники. Из железных предметов выделяются удила, стремена, топоры, серпы и режуще-колющее оружие (мечи, сабли, кинжалы, ножи, наконечники копий).
Особенно примечательны многообразные украшения, в первую очередь, предметы религиозного культа и погребального инвентаря, создания из бронзы, а также из кости и железа. Это гривны, кольца, браслеты, бляшки, пряжки, застёжки и фибулы, накладки, подвески, обкладки и др. и, кроме того ожерелья бус из стеклопласты, янтаря и ряды иных предметов.
Фонд "Документальный".
Документальный фонд состоит из группы исторических источников, разнообразных по времени происхождения, содержанию, оформлению, технике исполнения.
Условно документальный фонд делится на 2 группы:
1) письменные источники - рукописи, печатные и картографические материалы.
2) фото-источники, которые по целям создания и применения, в свою очередь, подразделяются на документальные, художественные, научно-технические, прикладные фото.
По жанрам фото-источники делятся на событийные, портретные, видовые, бытовые и т.д. Документальный фонд сгруппирован по отраслевому и тематико-хронологическому принципам. Хронологические рамки фонда - XVIII - начало XXI вв.
Фонд "Естественной истории".
Фонд "Естественной истории" включает в себя следующие коллекции:
1. "Зоология" - хранятся чучела птиц и млекопитающих, шкуры животных, скелетный материал.
2. "Ботаника" - состоит из гербариев. Хранятся как общие ("Растительность БАССР", "Флора Башкирии") так и тематические ("Медоносные растения БАССР", "Лекарственные растения РБ") гербарии. Первые из них собраны в 1866 году.
3. "Энтомология" - включает в себя коллекции насекомых из следующих отрядов: чешуекрылых, жёсткокрылых, полужёсткокрылых, перепончатокрылых, двукрылых и др.
4. "Палеонтология" - хранится костный материал плейстоценовых вымерших млекопитающих (элефантиды, носороги, бизоны, гигантские олени, пещерные медведи). Включает в себя кости конечностей, черепа, бивни, зубы, позвонки и т.д.
5. "Геология" - хранятся коллекции: полезных ископаемых, минералов, горных пород, руд (железных, золотосодержащих, цветных металлов), цветных и поделочных камней, метеоритов, а также коллекции по стратиграфии (окаменелые остатки растений и животных).
Фонд "Драгметалл".
Фонд драгметаллов очень разнообразен по виду предметов, которые в нем собраны. Здесь хранятся артефакты, содержащие драгоценные камни и металлы.
Это археологические, нумизматические, церковные предметы, посуда, часы, украшения - головные (накосники, налобники), шейно-нагрудные и нагрудные (ожерелья, колье, серьги, подвески, бусы, броши и т.д.), наручные (браслеты, перстни, кольца); украшения, изготовленные из серебра, кораллов с использованием камней-самоцветов сердолика, бирюзы, перламутровых пластин, морских раковин "каури" и т.д.
Фонд "Редких книг".
Коллекция фонда "Редкие книги" насчитывает 4202 единицы хранения. Он состоит из 5 коллекций, предназначенных для использования в экспозиционный и выставочный работе музея:
1) Книги, брошюры дореволюционного издания на русском и европейских языках.
2) Книги священного писания, богослужебная, литургическая литература, житие святых, песнопения, поучения, дореволюционная литература на церковно-славянском и русском языках.
3) Книги местного издания на башкирском и русском языках с дарственными и памятными надписями.
4) Издания разнообразного содержания на русском языке и языках народов СССР (до 1945 г.)
5) Арабо-графические издания и рукописи (до 30-х гг. XXв)
Фонд редких книг Национального музея Республики Башкортостан является частью библиотечного фонда РБ. Большую часть коллекции составляют издания, привезенные из этнографических экспедиций в конце 20-х годов XX в., книги и рукописи, переданные в фонд из библиотеки и документального фонда Национального музея Республики Башкортостан, приобретенные у жителей г. Уфы и районов Башкортостана. В коллекции рукописей хранятся работы М. Уметбаева, Р. Фахретдинова, Л. Гадилова и др.
Фонд "Текстиль".
В фонде "Текстиль" представлены:
праздничная и повседневная традиционная одежда, обувь, головные уборы народов Башкортостана: башкир, русских, татар, чувашей, мари и др.;
предметы декоративно-прикладного искусства: ткачество, вышивки, аппликации и т.д.;
военное обмундирование;
предметы городского быта, детская, спортивная одежда и т.п.;
церковная атрибутика;
знамёна, флаги, вымпелы и т.д.
Фонд "Металл. Фарфор. Стекло. Керамика".
В фондовой коллекции "Металл. Фарфор. Стекло. Керамика" хранятся предметы из металла, стекла, фарфора, керамики, камня, глины и т.п., имеющие музейно-историческую ценность. Этот фонд включает коллекции:
утюгов (угольные, огневые, электрические),
медных и латунных самоваров, производства разных тульских заводов н. XIX – XX вв.,
изделий заводов Касли (статуэтки, пепельницы, письменные приборы и т.д.),
орудий труда по обработке дерева, металла, сельскохозяйственных орудий и т.д.,
фарфоровых изделий (чашки, тарелки, вазы, сервизы и т.п.) фабрик М.С. Кузнецова (Москва, Санкт-Петербург), местных фарфоровых заводов (гг. Октябрьский и Туймазы),
различных сувениров из фарфора (подарки к юбилейным датам республики),
телефонных аппаратов, радиоприемников, швейных машин и т.д.,