Однако между летним и вторым осенним туром выборов Председателя ВС произошли известные августовские события, и когда съезд собрался вновь, в октябре фракция "Коммунисты России", до этого голосовавшая за Бабурина, заявила, что теперь поддерживает Хасбулатова. За Бабурина проголосовало 274 депутатов. Хасбулатов собрал 559 голосов из 943 присутствующих. Это определит позицию Сергея Николаевича в парламенте: его фракция "Россия" будет единственной всегда выступающей против "проельцинской марионетки Хасбулатова".
В августе С.Бабурин приостанавливает свое членство в КПСС, "посчитал позиию ее руководства в те дни предательской". Оценивая введение ГКЧП, он пишет: "Это был драматический акт, который я бы назвал заговором против Президента во имя Родины" и проводит аналогии с августом-сентябрем 1917 г. (Корниловский мятеж и пр.). Он считает, что "это был никакой не путч.., а левый коммунистический заговор всего союзного руководства... Поражение заговора стало началом настоящего переворота и ликвидации Советского Союза как государства". Он считает, что "КПСС как всесоюзная государственная партия, как стержень прежней государственной системы умерла. На ее обломках сумеют, но только снизу, сложиться несколько новых политических партий или движений. Я буду участвовать в воссоздании той, на знамени которой и в ее программе будут присутствовать три принципа: СПРАВЕДЛИВОСТЬ. НАРОДОВЛАСТИЕ. ПАТРИОТИЗМ".
После путча он одобряет действия Ельцина, высказавшего возможность предъявления территориальных претензий Казахстану (для Бабурина это существенно, он сам родился в этой республике).
Вместе с этим, как пишут в "патриотической" газете "Московский литератор", "... когда по доносу Евгения Евтушенко Гавриил Попов прислал революционных гвардейцев арестовать Союз писателей России, он (Бабурин - прим. авт.) вместе со своим другом и единомышленником Николаем Павловым был в забаррикадированном писательском доме, чтобы защитники этого последнего бастиона краткой перестроечной свободы не чувствовали себя одинокими, чтобы воодушевить их своей готовностью разделить с ними судьбу."
Осенью Бабурин оказался среди 50 народных депутатов, выступивших на Съезде против нового экономического курса Бориса Ельцина. Сергей Николаевич вспоминает, что "Борис Николаевич говорил, что знает, как осуществить экономическую реформу без повышения цен и падения жизненного уровня начеления". В результате же, по словам Бабурина, "через полгода уже разграбят все... Не зря говорится, что благими намерениями выстлана дорога в ад".
В октябре 1991 Бабурин отправляется в первый из своих вояжей по "горячим точкам" страны, которые становятся для него обычными - вместе с Николаем Павловым он посещает Курилы, которые оказались в этот период в центре общественного внимания из-за обсуждавшегося вопроса о возможной передачи части этих островов Японии. Результаты поездки были обнародованы на прессконференции в Белом доме 15 октября. Двумя днями позже "Советская Россия" опубликовала большую статью под названием "Родиной не торгуют", в которой Бабурин и Павлов представили свой пакет предложений по курильской проблеме: - о необходимости принятия Верховным Советом РСФСР или Президентом законодательного акта по проблеме Курил (их экономическом и культурном возрождении, аналогично принятому решению по Тюменской области); о поддержке инициативы сахалинского руководства (Федорова-Аксенова) по созданию на базе Курильских островов особой экономической зоны ("не свободной экономической зоны, каковой является вся Сахалинская область, а особой... при японском участии,.. в которую вошла бы и часть о.Хоккайдо" и т.п.); о пагубности "гонки" за иностранными кредитами - "эти самые кредиты,.. будут способствовать консервированию сегодняшних экономических отношений, удержат у власти отжившие структуры и станут помехой развития новой экономики".
25 октября 1991 г. Сергей Кургинян обнародовал новые результаты своих изысканий в "математической политологии", главный вывод которых возвещал объективную неизбежность возникновения политической силы с консервативно-державной идеологией "автаркического развития". До конца года (будто по кургиняновскому велению) такая сила попыталась заявить о себе двумя учредительными съездами - Партии Возрождения и Российского общенационального союза (РОС) (20 декабря). На вопрос корреспондента "Независимой газеты" лидер РОС Сергей Бабурин ответил, что организаторы-"возрожденцы" так и не смогли убедить его в том, что необходимо создать партию - он считает, что "нужно общественное движение, основанное на государственно-патриотических принципах... Беды патриотизма (в том числе ПВ) в нашей стране коренятся в отрыве его от демократических устремлений". Расчет Рос сделал на соединение "народосластия с патриотизмом", не случайно из 400 участников учредительного съезда было около 120 депутатов разного уровня. "Младопатриоты" (в терминологии Кургиняна РОС и Партия Возрождения) расчитывают на союз с "белыми коммунистами" и "демократами-государственниками" (среди последних Демократическая партия России и ее сторонники по блоку "Народное согласие"). Устав ПВ даже допускает "двойное членство" - для лучшего привлечения сторонников.
РОС в своем программной заявлении выразил готовность "взять на себя свою часть повседневной тяжелой работы по обустройству России". "Наши принципы, - говорится в нем, - НАРОДОВЛАСТИЕ, ПАТРИОТИЗМ, СПРАВЕДЛИВОСТЬ". РОС обязался отстаивать "национальное примирение" и территориальную целостностность российского государства...
Бабурин считает, что "необходимо отложить спор о социализме и капитализме до лучших времен, а заниматься вопросом сохранения державы".
Между тем в Омске разгорелся новый скандал в связи с продолжением кампании по отзыву Бабурина. После того как ее организаторы заявили о том, что собрано необходимое количество подписей (более 12 тыс.), Советский райисполком, реагируя на жалобы избирателей, провел выборочную проверку подписных листов и объявил об обнаружении подтасовки и фальсификации. В адрес Президиума Верховного Совета РСФСР были направлены клубом избирателей подписные листы, а также решение исполкома об итогах работы отзывной группы и обширная пояснительная записка к нему. Между тем, используя то обстоятельство, что проверка проводилась негласно, избиратели-"отзовисты", со своей стороны, обвинили в "тайной фальсификации" листов саму комиссию исполкома райсовета. Решение конфликта обе стороны ожидали от Верховного Совета, который как предполагалось создаст парламентскую комиссию для тщательной проверки, в том числе графологической. Парламент, однако, это предложение проигнорировал...
В ноябре 1991 г. координаторы фракции "России" В.Сердюков, В.Мазаев и С.Бабурин предложили принять специальное постановление об обязательном декларировании доходов всеми народными депутатами РСФСР, Президентом России, Президентами республик в составе РСФСР, членами администрации и должностными лицами президентского аппарата, руководителями исполнительных органов республик, краев, областей, городов и районов. Необходимость такой меры авторы проекта обосновывали важностью усиления контроля за законностью и справедливостью приватизации государственного имущества в связи с широкомасштабной и быстрой приватизацией и распространенной практикой участия в коммерческой деятельности народных депутатов и должностных лиц различного уровня. Предложение кануло без последствий...
В декабре критический для СССР момент: открытое голосование о ратификации Беловежского договора о создании СНГ: лишь шесть парламентариев решаются проголосовать против, среди них Бабурин.
В это же время в парламенте Бабурин выступает в поддержку рижского ОМОНа, против сторонней позиции России при "продаже" Эриха Хонеккера, а также продолжает критику российского руководства, лейтмотивом которой служит тезис о "распродаже" российского достояния - "... торги идут по всем направлениям. Мы торгуем сырьем, мы торгуем территорией, мы торгуем гражданами... Мы сегодня должны признать, что государство оказалось не способно защищать никого и ничего". Он ставит перед парламентом вопрос о территориальной целостности уже России и проблемах безопасности государства, имея в виду и проблему Южной Осетии.
В ответ инициативная группа противников Сергея Николаевича все же организует 12 января 1992 г. голосование по отзыву депутата в Советском территориальном округе No 539 Омской области, где выдвинут был Бабурин. Однако их постигла очередная неудача: набрано было лишь 57% необходимого для отзыва числа голосов.
В феврале 1992 г. в связи с празднованием 49-й годовщины разгрома немецко-фашистских войск под Сталинградом С.Бабурин и В.Алкснис приезжают в Волгоград. Поездка была использована для заявления своей политической позиции. Так, Бабурин, выступил на митинге, проходившем под лозунгами "Реформы правительства выгодны только мафии - долой!", "Нет доверия Ельцину", организованном местной организацией Социалистической партии трудящихся, и предложил внести в его резолюцию призыв бороться за единство армии и флота, а также пункт: считать политику правительства предательством заветов воинов-участников Сталинградской битвы.