Генеральную прокуратуру РФ (и одновременно всю систему прокуратуры РФ) возглавляет Генеральный прокурор РФ. Генеральный прокурор РФ имеет первого заместителя и заместителей, чьи служебные обязанности определяются Генеральным прокурором РФ.
Структуру Генеральной прокуратуры РФ составляют главные управления (Главное следственное управление, состоящее из управления по надзору за расследованием преступлений и следственного управления); управления (организационно-контрольное, кадров, по надзору за исполнением законов и законностью правовых актов, по надзору за исполнением законов о федеральной безопасности, по делам о несовершеннолетних и молодежи, второе управление, по надзору за законностью судебных постановлений по уголовным делам, по надзору за законностью постановлений судов по гражданским делам, по обеспечению участия прокуроров в арбитражном процессе, по надзору за исполнением законов на транспорте и в таможенных органах, по надзору за исполнением уголовных наказаний, международно-правовое управление и некоторые другие); отделы на правах управления (безопасности, реабилитации жертв политических репрессий, криминалистики, писем); отделы в составе управлений (организационного обеспечения, планирования и контроля, статистики и анализа - в организационно-контрольном управлении; первый, второй, третий, пенсионный - в управлении кадров; по надзору за соблюдением прав и свобод граждан, по надзору за исполнением законов в сфере экономики, по надзору за законностью правовых актов, по надзору за исполнением природоохранного законодательства и др. - в управлении по надзору за исполнением законов и законностью правовых актов; по надзору за следствием, дознанием и оперативно-розыскной деятельностью в федеральных органах налоговой полиции, по надзору за следствием, дознанием и оперативно-розыскной деятельностью в МВД РФ, по надзору за расследованием особо важных дел в Генеральной прокуратуре РФ, по расследованию преступлений в сфере экономики, по расследованию бандитизма, умышленных убийств и др. - в главном следственном управлении) и т.д.
В структуру Генеральной прокуратуры РФ, помимо названных, входят и такие подразделения, как Секретариат Генерального прокурора РФ (на правах управления); центр информации и общественных связей (на правах управления); приемная (на правах управления) и некоторые другие.
В структуру Генеральной прокуратуры РФ входит коллегия, возглавляемая Генеральным прокурором РФ, в которую входят первый заместитель и заместители Генерального прокурора РФ (по должности) и другие прокурорские работники, назначаемые Генеральным прокурором (некоторые начальники управлений Генеральной прокуратуры РФ, директор НИИ проблем укрепления законности и правопорядка и др.).
В Генеральной прокуратуре РФ на основании положения, утверждаемого Генеральным прокурором РФ, действует Научно-консультативный совет, в состав которого входят прокурорские работники и ученые.
В названные структурные подразделения Генеральной прокуратуры РФ включены должности старших прокуроров и прокуроров, старших прокуроров-криминалистов и прокуроров-криминалистов, старших следователей по особо важным делам и следователей по особо важным делам, а также их помощников.
Структура прокуратур субъектов РФ и приравненных к ним военных и иных специализированных прокуратур имеет большое сходство со структурой Генеральной прокуратуры РФ, хотя и ограничена в размерах в силу различия компетенции.
Возглавляют эти прокуратуры прокуроры субъектов РФ и приравненных к ним прокуратур, их первые заместители и заместители. Структуру названных прокуратур составляют управления и отделы (на правах управлений или в составе управлений). Численность таких управлений и отделов значительно меньше, чем в структуре Генеральной прокуратуры РФ.
Структура и численность состава конкретной прокуратуры субъекта РФ, города, района или приравненных к ним прокуратур зависит от социально-экономической характеристики региона, на территории которого действует прокуратура, численности населения и других факторов.
Под организацией прокуратуры РФ понимается установленный Конституцией РФ и Законом о прокуратуре порядок назначения на должность прокурорских работников и порядок создания и ликвидации отдельных органов прокуратуры. Организацию прокуратуры РФ следует отличать от организации прокурорского надзора как основной функции органов прокуратуры, которая будет рассмотрена в последующих разделах, посвященных отдельным направлениям прокурорского надзора.
В ч. 2 ст. 129 Конституции РФ предусмотрено, что Генеральный прокурор РФ назначается на должность и освобождается от должности Советом Федерации по представлению Президента РФ. Это положение получило дальнейшее развитие в Законе о прокуратуре. Согласно ст. 12 названного Закона, если предложенная Президентом РФ кандидатура на должность Генерального прокурора РФ не получит требуемого количества голосов членов Совета Федерации, то Президент РФ в течение 30 дней представляет Совету Федерации новую кандидатуру. К сожалению, Закон о прокуратуре не определяет, сколько раз Президент РФ может входить в Совет Федерации с таким предложением, если его кандидатуры будут отклоняться.
Недостаточно полно урегулирован вопрос и об освобождении Генерального прокурора РФ от должности. В Законе не определено возможное количество представлений Президента РФ об освобождении от должности Генерального прокурора РФ, если Совет Федерации не согласится с представлением Президента РФ, а также сроки внесения таких представлений.
Назначенный на должность Советом Федерации Генеральный прокурор РФ обязан согласно п. 3 ст. 12 Закона о прокуратуре принять присягу, причем текст ее отличается от текста присяги, принимаемой согласно ст. 40' названного Закона всеми остальными прокурорами (следователями).
Текст присяги Генерального прокурора РФ гласит: "Клянусь при осуществлении полномочий Генерального прокурора Российской Федерации свято соблюдать Конституцию Российской Федерации и законы Российской Федерации, защищать права и свободы человека и гражданина, охраняемые законом интересы общества и государства".
Срок полномочий назначенного Генерального прокурора РФ - пять лет. Порядок освобождения Генерального прокурора РФ от должности по истечении пятилетнего срока и назначения этого же лица на должность Генерального прокурора РФ на новый срок, так же как и количество таких пятилетних сроков, Законом не регламентируется.
В отсутствие Генерального прокурора РФ или в случае невозможности исполнения им своих обязанностей (отпуск, длительная зарубежная командировка, отстранение от должности) его обязанности исполняет первый заместитель, а в случае его отсутствия или невозможности исполнения им обязанностей обязанности Генерального прокурора РФ исполняет один из заместителей Генерального прокурора РФ.
Первый заместитель и заместители Генерального прокурора РФ согласно п. 2 ст. 14 Закона о прокуратуре назначаются на должность и освобождаются от должности Советом Федерации по представлению Генерального прокурора РФ.
Согласно ст. 401 Закона о прокуратуре прокурорами и следователями могут быть граждане Российской Федерации, имеющие высшее юридическое образование, полученное в образовательном учреждении высшего профессионального образования, имеющем государственную аккредитацию, обладающие необходимыми профессиональными и моральными качествами, способные по состоянию здоровья выполнять возложенные на них служебные обязанности.
На должности прокурора города, района, приравненных к ним прокуроров назначаются лица не моложе 25 лет, имеющие стаж работы прокурором (помощником прокурора, прокурором отдела) или следователем в органах прокуратуры не менее 3-х лет.
На должности прокуроров субъектов РФ, приравненных к ним прокуроров назначаются лица не моложе 30 лет, имеющие стаж работы прокурором или следователем в органах прокуратуры не менее 5 лет. Указанное требование вполне объяснимо, так как для руководства коллективом прокурорских и следственных работников городской, районной или приравненной к ним прокуратуры, а тем более прокуратуры субъекта РФ требуются не только профессиональные знания, но и жизненный опыт, необходимый для решения повседневных сложных вопросов социальной, экономической и политической действительности.
Организация прокуратуры РФ предполагает не только порядок назначения соответствующих требований лиц на должности в органах прокуратуры, но и создание или ликвидацию самих органов прокуратуры. Согласно п. 2 ст. 11 Закона о прокуратуре образование, реорганизация и ликвидация органов и учреждений прокуратуры, определение их статуса и компетенции осуществляются Генеральным прокурором РФ. При этом принимаемые решения всегда определяются социальными, экономическими или политическими процессами, происходящими в стране, задачами, которые ставятся перед прокуратурой РФ государством в лице высших органов законодательной и исполнительной власти. Такие задачи могут определяться государственной необходимостью укрепления законности в отдельных регионах (Кавказ), сферах общественных отношений (экологическая безопасность), расширением сферы определенных правонарушений (таможенный контроль), изменениями административно-территориального деления и т.д. Этими же причинами может быть обусловлено принятие решений о реорганизации или ликвидации органов и учреждений прокуратуры.
Особо следует подчеркнуть, что при осуществлении такого рода организационных мероприятий недопустимо создание или осуществление деятельности на территории Российской Федерации органов прокуратур, не входящих в единую систему прокуратуры РФ.
Организация органов прокуратуры РФ осуществляется через издаваемые Генеральным прокурором РФ соответствующие приказы, указания, распоряжения, положения и инструкции, с помощью которых Генеральный прокурор РФ в пределах выделенной штатной численности и фонда оплаты труда устанавливает штаты и структуру Генеральной прокуратуры РФ и нижестоящих прокуратур, определяет полномочия структурных подразделений, решает иные организационные вопросы (строительства необходимых помещений, материально-технического снабжения и т.п.).