В 1980 советские войска вторглись в Афганистан. СССР наложил вето на резолюцию Совета с осуждением агрессии. После десятилетних дипломатических усилий и вывода советских войск из Афганистана Совет поддержал мирный процесс и отправил на выборы наблюдателей ООН.
В эти годы Совет занимался также конфликтом в Никарагуа. Начиная с 1983 принимались меры по предотвращению войны в Никарагуа, а в 1985 Совет повторно подтвердил право Никарагуа решать политические, экономические и социальные проблемы самостоятельно, без вмешательства извне.
После Иранской революции 1979 Совет единогласно призвал к освобождению заложников США, но эта попытка не принесла успеха. Усилия Совета завершить ирано-иракскую войну сводились к принятию многочисленных резолюций; в июльской резолюции № 598 от 1987 определялись основные условия прекращения огня. Совет учредил также группу наблюдателей, чтобы отслеживать случаи нарушения соглашения по прекращению огня.
В 1987 на Ближнем Востоке началась палестинская интифада. США под давлением остальных членов Совета согласились направить представителя Генерального секретаря для изучения условий проживания палестинцев на оккупированных территориях. Но этот шаг мало изменил ситуацию. Из-за кризиса в Персидском заливе в 1990–1991 положение на Ближнем Востоке крайне осложнилось. Совет приступил к дискуссиям о том, как отвечать на военные действия израильтян против палестинского гражданского населения. Принятие резолюции, осуждавшей убийство по меньшей мере 18 палестинцев в 1990 в мечети Омара, было отложено на 7 недель, поскольку дипломаты из США работали над смягчением ее формулировок.
В 1982 шедшая в Ливане гражданская война осложнилась вторжением в страну войск Израиля. Совет направил наблюдателей в Бейрут и осудил зверские убийства в лагерях для беженцев. Хотя резолюция № 425 потребовала немедленного и безоговорочного вывода израильских войск с оккупированных территорий южного Ливана, Израиль не подчинился этому решению.
Пик активности Совета относится к 1990–1991, когда в Персидском заливе разразился кризис. Через несколько часов после вторжения Ирака в Кувейт 2 августа 1990 посол США Томас Пикеринг потребовал чрезвычайного заседания Совета Безопасности. Резолюция № 660 осудила вторжение, а 29 ноября 1990 резолюция № 678 разрешила отдельным странам выступить против Ирака. За ее принятие проголосовали 12 членов Совета, 2 выступили против (Куба и Йемен) и один воздержался (Китай).
Добиваясь поддержки государств-членов, США предприняли беспрецедентные экономические и политические действия. Голосование констатировало также, что с крушением советского блока и последующим распадом СССР Совет больше не будет подчиняться логике противостояния двух сверхдержав.
В конце 1991, после распада СССР, Совет без обсуждения принял решение о замещении Российской Федерацией места СССР в качестве постоянного члена.
В 1992 соглашению по Кампучии угрожал отказ красных кхмеров выполнить требование мандата ООН о разоружении. Каждые три месяца возобновлялись санкции против Ирака, что не привело к отстранению от власти Саддама Хусейна. Гражданская война в Сомали привела к голоду сотен тысяч людей, но Совет мало что мог сделать помимо введения эмбарго на военные поставки. Падение коммунистических режимов в СССР и Восточной Европе повлекло за собой вспышки этнического насилия в новых независимых государствах, таких, как Грузия и Молдова, а также в Нагорном Карабахе. Совет сосредоточил свою деятельность на разрешении новых конфликтов, в первую очередь на войне в Боснии и Герцеговине.