Органы местного самоуправления также являются субъектами административного права. Особое значение имеет принятый 15 октября 1999 г. указ Президента РФ № 1370 «Об утверждении основных положений государственной политики в области развития местного самоуправления в РФ».
В период проведения реформы местного самоуправления реализуются большие полномочия органов МСУ по реализации местных и региональных программ на средства, выделяемые из государственного бюджета. И основной вопрос стоит не в мере самостоятельности в процессе реализации основных задач и функций на местах, а в размерах материальных и финансовых средств, выделяемых государственными органами власти органам местного самоуправления, кадровом обеспечении и осуществлении государственного контроля за их расходованием, т.е. обеспечения ответственности за результаты деятельности органов МСУ.
Необходимо определить законодательно-финансовую самостоятельность органов местного самоуправления и их ответственность за реализацию государственных функций и задач по экономическому и социальному развитию районов и особенно социальной защиты населения муниципального образования. Федеральным законом от 25.09.1999 г. «О финансовых основах местного самоуправления в РФ» были регламентированы правовые основы формирования и исполнения местных бюджетов.
В большинстве зарубежных государств органы местного самоуправления всегда были оплотом государственности против различного рода сепаратизма, в России же все наоборот, так как традиционно у нас «уважали» и выполняли, прежде всего, волю начальника, потом уже по возможности подгоняли эти действие под закон.
В настоящее время наиболее актуальной задачей является укрепление государственности, его целостности, что и делается Президентом РФ и его реорганизованным институтом полномочных представителей. Поэтому особое внимание должно уделяться формированию и укреплению целостной системы исполнительной власти РФ, оптимизации организационных структур ФОИВ в целях эффективного осуществления объективных функций и задач государственного управления. Действующая нормативная база правового регулирования организации деятельности исполнительной власти еще недостаточно отработана. В Конституции РФ установлены схематично лишь ее принципиальные положения. Не урегулированы нормами и правила, взаимоотношения между главой администрации органов МСУ и федеральными органами власти, главой администрации и законодательным органом субъектов РФ. В связи с этим возникает множество трудноразрешимых ситуаций, снижающих общую эффективность работы различных структур исполнительной власти на всех уровнях, и особенно на уровне субъектов РФ и органов МСУ.