Победа Юрия оказалась, однако, весьма призрачной. Когда звенигородский князь захватил Москву и сел на великом княжении, перед ним встал вопрос - что делать с племянником? Под влиянием своего любимца боярина Семена Федоровича Морозова Юрий отдал своему бывшему противнику в удел Коломну. Многие бояре, принявшие сторону Юрия, убеждали его не совершать этого шага, но Юрий, упоенный победой и наружной покорностью Василия, не стал их слушать. Последствия этого промаха сказались очень быстро. Коломна стала местом сбора всех недовольных. Московские бояре и слуги, люди из всех уголков великого княжения, по выражению летописца "от мала и до велика" начали отказываться от Юрия и отъезжать в Коломну. Дело кончилось тем, что Юрий остался в Москве по существу один и вынужден был покинуть город. Уезжая, он послал сказать своему племяннику: "Поиде на Москву на великое княжение, а яз иду в Звенигород". Так безуспешно окончилась его попытка овладеть великокняжеским столом.
Между Юрием и его племянником был заключен договор, в котором Юрий признавал себя "братом молодшим" и обязывался не принимать к себе своих старших сыновей Василия Косого и Дмитрия Шемяку[5], продолжавших борьбу с великим князем, не помогать им, и отдать ханский ярлык на Дмитров. Со своей стороны московский князь уступал Юрию бывший удел князя Константина Дмитриевича: волости Сурожик, Лучинское, Щелкову и ряд других владений.
Сыновья Юрия, заняв Кострому, не собирались мириться с великим князем. Московское правительство послало против них сильную рать во главе с князем Юрием Патрикеевичем. Бой произошел на берегу р. Куси, московская рать была разбита, а воевода попал в плен. В Москве узнали, что в сражении на р. Куси, кроме войск сыновей Юрия участвовали и его собственные бояре, тем самым грубо нарушив только что заключенное соглашение. Зимой 1434 г. Василий Темный пошел с ратью на Галич, Юрий бежал на Бело-озеро, в его отсутствие Галич был взят, повергнут разорению и сожжен, а московский князь вернулся с огромным полоном. Возвратившись после ухода великокняжеской рати, Юрий послал за сыновьями, а в помощь к себе призвал вятчан. Весной войска противников встретились около монастырька святого Николы между Ростовом и Переяславлем. С Юрием были все три его сына, на стороне Василия лишь один союзник - князь Иван Андреевич Можайский, в решительную минуту проявивший колебания и растерянность. В сражении успех был на стороне Юрия. Великий князь бежал в Новгород, а его союзник - к Твери. Юрий продвигался к Москве, в Троицком монастыре к нему присоединился можайский князь, изменивший Василию, и взявший сторону сильнейшего из противников. Неделю простоял Юрий под Москвой, и 1 апреля 1434 г. она сдалась на милость звенигородскому князю. В городе он нашел великокняжескую казну, мать и жену Василия, которых поспешил выслать в Звенигород и Рузу. Против бежавшего великого князя, который, не видя ни откуда помощи и поддержки, решился направиться в Орду, были посланы младшие сыновья Юрия - Дмитрий Шемяка и Дмитрий Красный. Но когда они были еще только во Владимире, из Москвы пришла весть о смерти Юрия 5 июня и о том, что на великокняжеском столе оказался их старший брат Василий Косой. Так закончился первый этап феодальной войны второй четверти XV в.
По своей духовной грамоте, составленной в 1433 г., князь Юрий разделил свой удел между тремя сыновьями. Старший Василий Косой получил Звенигород с волостями. Среднему Дмитрию Шемяке досталась Руза и волости. Младший из братьев Дмитрий Красный получил вышгородские земли.
Воля Юрия, выраженная в его духовной грамоте, осталась не выполненной. Дмитрий Шемяка и Дмитрий Красный, посланные отцом вдогонку убегавшему великому князю, получив во Владимире известие о смерти отца и вокняжении на Москве их старшего брата, круто изменили свою политику и отказались признать его великим князем, послав в Нижний Новгород за своим двоюродным братом. Между недавними соперниками было заключено соглашение, и трое князей направились к Москве. Василий Косой, пробыв на московском столе всего один месяц, был вынужден бежать через Ржеву в Новгород, а оттуда в Кострому. Таким образом Василий вернул себе княжение. Тем не менее, положение его оставалось довольно непрочным. Борьба Василия Темного с Василием Косым продолжалась с переменным успехом до весны 1436 г., когда Василий Косой был захвачен в плен и ослеплен. О дальнейшей его судьбе летописи молчат, сообщая лишь о его смерти в 1448 г. Судя по всему, все эти годы он находился в заточении. Сразу же после захвата Василия Косого великий князь поспешил заключить договор с князем Дмитрием Красным, согласно которому Звенигород окончательно закреплялся за московским князем, а после смерти Дмитрия Красного [6]в 1441 г. все звенигородские земли сосредоточились в руках Василия Темного.
В 40-е годы XV в. феодальная война возобновилась, и на этот раз противником великого князя был другой сын Юрия - Дмитрий Шемяка. Борьба шла с переменным успехом, осложняясь вмешательством татар, и с большим ожесточением. На стороне великого князя были князь Василий Ярославич Серпуховской и Михаил Андреевич Верейский. Желая крепче привязать к себе союзников, он уступает им звенигородский удел Василия Косого.
В 1442 г. было "взвергнуто нелюбие" и на Шемяку, которому при новых условиях некуда было укрыться и не на кого опереться; состоялось, однако, примирение при содействии троицкого игумена. В то же время не был принят заключивший Флорентийскую унию митрополит Исидор
В этот период активизировался хан Улу-Махмет, который занимал город Беляев. Московские войска осадили Беляев, в намерении уничтожить хана, не соглашаясь на предложение Улу-Махмета полностью отдаться на волю Василию Темному. Но московские войска начали атаку. Неожиданно, литовский воевода, присланный на помощь русскому войску переметнулся на сторону хана, вызвав поражение московских воевод. Окрыленный успехом, Улу-Махмет беспрепятственно прошел к Нижнему Новгороду, и сделал разрушительный набег на Москву; великий князь успел бежать, каменный "город" уцелел, но посады и окрестности (до Коломны включительно) сильно пострадали. Нижний Новгород, у которого основалась Орда Улу-Махмета, находился в осаде.
В 1445 г. удалось отбить наступление хана. Обрадованный Василий решил укрепить свои позиции и встретить пасху в Москве. Пользуясь слабостью гарнизонов, Махмет неожиданно напал на Василия II у города Юрьева и взял его в плен, предложив тяжелейшие условия выкупа. Это создало благоприятные условия для Шемяки, привлекшего на свою сторону тверского и можайского князей. В феврале 1446 г. Василий II был захвачен в Троицком монастыре князем можайским, а Москва занята Шемякой. Приказом Шемяки Василий Темный был ослеплен. Шемяка и его сподвижник рязанский епископ Иона, которому была обещана митрополия, обманом выманили детей Василия Темного в Москву, там схватили и заточили в Углич вместе с самим Василием.
Но Литва, в которой нашли убежище сторонники Василия возроптала от недовольства, угрожая Шемяке и Ионе, на церковно-боярском совете в 1446г. добилась освобождения слепого Василия и его детей. В качестве вотчины бывший князь получил Вологду, в которой мгновенно началось сколачивания движения направленного против Шемяки. Позже центр этого движения был перенесен в Тверь, куда стеклись так же сторонники Василия Темного из Литвы. В Твери же была спланирована операция по освобождению Москвы от Шемяки. Дождавшись отъезда Шемяки из Москвы, отряд сторонников Василия захватили близких Шемяке людей и привели к присяге московскую массу, тем самым сильно ухудшив положение Шемяки. Так же князя Можайский, а также рязанский, боровский и верейский были связаны подчиняющими договорами. Тогда же состоялось официальное посвящение Ионы в митрополиты собором церковным; в послании, извещавшем об этом, Иона заклинает всех, кто еще не перешел на сторону Василия II, бить челом восстановленному великому князю, под угрозой церковного отлучения. В 1449 году Шемяка вновь попробовал отвоевать Москву. Но натолкнулся на сильнейшее сопротивление войск великого князя, а так же митрополита и епископов. В 1450 г. Шемяка был окончательно обессилен под Галичем и бежал в Великий Новгород. Оттуда в 1452 г. он сделал вылазку, кончившуюся неудачно. В 1453 г. он внезапно скончался. Считается, что он был отравлен сподвижниками Василия Темного.
Можайский князь бежал в Литву, и Можайск присоединен к Москве в 1454 г. Спустя два года то же случилось с боровским князем. Дошла очередь и до Великого Новгорода; новгородские войска потерпели поражение, Новгород был приведен к покорности великому князю на небывало тяжелых условиях: 10000 контрибуция, отмена вечевых грамот, замена новгородской печати печатью великого князя. Это было начало конца новгородской самостоятельности. В 1458 - 1459 годах и Вятка, в усобице 30-х годов стоявшая на стороне Юрия и его сыновей, вынуждена была "добить челом на всей воле великого князя". В 50-х же годах рязанский князь поручил свое княжество и сына московской опеке, выразившейся в посылке туда наместников.
Феодальная война в русском государстве имела очень показательный характер. Эта война как и любая другая понесла за собой множество потерь и разорения. Разрозненные княжества были разорены и понесли тяжкие потери в населении и экономических связях. Частая смена хозяев вызвала нестабильность среди жителей различных княжеств. Последствия этого конфликта еще долго давали о себе знать. Но в общем и целом в сложившейся ситуации (татаро-монгольское иго, феодальная раздробленность, постоянные распри князей), негативные последствия войны оказались не самыми худшими. Все могло быть намного хуже.