Дальнейшая компактизация нуклеосомной нити обеспечивается гистоном Н1, который, соединяясь с линкерной ДНК и двумя соседними белковыми телами, сближает их друг с другом. В результате образуется элементарная хроматиновая фибрилла, имеющая диаметр 20-30 нм и длину 1,2 мм.
Следующий уровень структурной организации генетического материала обусловлен укладкой хроматиновой фибриллы в петли (рисунок 39). В результате такой упаковки хроматиновая фибрилла диаметром 20-30 нм преобразуется в структуру диаметром 100-200 нм, называемую интерфазной хромонемой.
Молекула ДНК имеет значительную протяжённость. Ген – это участок молекулы ДНК протяжённостью около 1000 нуклеотидов. Ген включает в себя не только структурную часть, но и регуляторные последовательности. В 1961 г. Жакоб и Моно выдвинули предположение, что транскрипция генов находится под контролем регуляторного участка, названного оператором (О). Регуляция транскрипции на операторном участке осуществляется репрессором, вырабатываемым геном-индуктором (I). Репрессор, связываясь с оператором, подавляет транскрипцию. Если же репрессор связывается с индуктором, то происходит диссоциация комплекса репрессор-оператор и тем самым делая возможным транскрипцию (рисунок 40).
Синтез м-РНК (и-РНК) начинается с обнаружения РНК-полимеразой особого участка на молекуле ДНК (промотор), который указывает место начала транскрипции. После присоединения к промотору РНК-полимераза раскручивает виток спирали ДНК и две её цепи расходятся. Сборка рибонуклеотидов в цепь происходит с соблюдением их комплементарности нуклеотидам ДНК, а также антипараллельно по отношению к матричной цепи ДНК. В связи с тем, что РНК-полимераза способна собирать полинуклеотид лишь от 5′- к 3′-концу, матрицей для транскрипции может служить только та цепь, которая обращена к ферменту 3′-концом (эту цепь называют кодогенной).
РНК-полимераза, продвигаясь вдоль кодогенной цепи ДНК, осуществляет понуклеотидное переписывание информации до тех пор, пока не встретит специфическую нуклеотидную последовательность – терминатор. В этом участке РНК-полимераза отделяется как от матрицы ДНК, так и от вновь синтезированной м-РНК. По мере продвижения РНК-полимеразы пройденные ею одноцепочечные участки ДНК вновь объединяются в двойную спираль.
В отличие от прокариотических генов большинство генов эукариот прерывисты, т.к. в своём составе несут не только смысловые экзоны, но и неинформативные нуклеотидные последовательности – интроны. В связи с этим первичные транскрипты образуют так называемую гетерогенную ядерную РНК (гя-РНК), которая ещё находясь в ядре, подвергается процессингу и только после этого превращается в зрелые м-РНК (рисунок 41).Процессинг (созревание) гя-РНК предполагает модифицирование первичного транскрипта и удаление из него некодирующих интронных участков с последующим соединением (сплайсинг) кодирующих последовательностей – экзонов. Кроме сплайсинга во время процессинга происходит также модифицирование первичного транскрипта с 5′-конца путём образования колпачка – кэп, который обеспечивают узнавание молекул м-РНК рибосомами цитоплазмы (рисунок 42).
Кроме того, происходит удаление части нуклеотидов на 3′-конце первичного транскрипта и присоединение к нему последовательности, состоящей из 100-200 остатков адениловой кислоты (поли-А). Считается, что эта последовательность способствует энергетическому обеспечению дальнейшего процессинга и транспорта зрелой м-РНК из ядра в цитоплазму.
Наряду с кэпированием и полиаденилованием первичного транскрипта происходит удаление неинформативных для данного белка интронных участков, размер которых варьирует от 100 до 10000 нуклеотидов и более. На долю интронов приходится около 80 % всей гя-РНК. Удаление интронов с последующим соединением экзонов осуществляется специальными структурами – малыми ядерными РНК (мя-РНК).
В настоящее время доказана возможность альтернативного сплайсинга, при котором на одном первичном транскрипте могут удаляться разные нуклеотидные последовательности и образовываться различные зрелые м-РНК.
Наследственная информация, записанная с помощью генетического кода, хранится в молекулах ДНК и непосредственного участия в жизнеобеспечении клеток не принимает. Роль посредника в переводе наследственной информации, хранимой в ДНК, в рабочую форму играют рибонуклеиновые кислоты – РНК.
Молекулы РНК состоят из четырёх типов нуклеотидов, содержащих сахар рибозу, фосфат и одно из четырёх азотистых оснований – аденин, гуанин, цитозин, урацил. Всё многообразие РНК, действующих в клетке, можно разделить на три основных вида: м-РНК, т-РНК, р-РНК.
Матричная РНК (м-РНК) синтезируется РНК-полимеразой на ДНК как копия соответствующего гена. Этот процесс называется транскрипцией. Тройки рядом стоящих нуклеотидов м-РНК, шифрующие определённые аминокислоты, называются кодонами (триплеты). Таким образом, последовательность кодонов м-РНК шифрует последовательность аминокислот в пептидной цепи (рисунок 43, таблица 10).
Генетический код характеризуется следующими основными свойствами:
¨ универсальность для живых организмов,
¨ триплетность (состоит из трёх нуклеотидов),
¨ неперекрываемость (азотистые основания одного триплета не входят в состав других соседних триплетов),
¨ вырожденность (одна аминокислота может кодироваться несколькими триплетами).
Таблица 10 – Последовательность нуклеотидов в кодонах и-РНК для разных аминокислот
Аминокислоты | Кодоны | |||||
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | |
Фенилаланин (фен) | УУУ | УУЦ | ||||
Лейцин (лей) | УУА | УУГ | ЦУУ | ЦУЦ | ЦУА | ЦУГ |
Изолейцин (илей) | АУУ | АУЦ | АУА | |||
Метионин (мет) | АУГ | |||||
Валин (вал) | ГУУ | ГУЦ | ГУА | ГУГ | ||
Серин (сер) | УЦУ | УЦЦ | УЦА | УЦГ | АГУ | АГЦ |
Пролин (про) | ЦЦУ | ЦЦЦ | ЦЦА | ЦЦГ | ||
Треонин (тре) | АЦУ | АЦЦ | АЦА | АЦГ | ||
Аланин (ала) | ГЦУ | ГЦЦ | ГЦА | ГЦГ | ||
Тирозин (тир) | УАУ | УАЦ | ||||
Гистидин (гис) | ЦАУ | ЦАЦ | ||||
Глутамин (глн) | ЦАА | ЦАГ | ||||
Аспарагин (асн) | ААУ | ААЦ | ||||
Аспарагиновая кислота (асп) | ГАУ | ГАЦ | ||||
Лизин (лиз) | ААА | ААГ | ||||
Глутаминовая кислота (глу) | ГАА | ГАГ | ||||
Цистеин (цис) | УГУ | УГЦ | ||||
Триптофан (трип) | УГГ | |||||
Аргинин (арг) | ЦГУ | ЦГЦ | ЦГА | ЦГГ | АГА | АГГ |
Глицин (гли) | ГГУ | ГГЦ | ГГА | ГГГ | ||
Охра* | УАА | |||||
Амбер* | УАГ | |||||
Опал* | УГА | |||||
* Примечание: охра, амбер, опал – условные названия терминирующих триплетов (нонсенс-кодоны) |
.