Существенным является наличие в модельном комплексе двух основных уровней. На первом из них – федеральном - осуществляется расчет основных макроэкономических и отраслевых показателей в целом для Российской Федерации. В свою очередь, расчеты на федеральном уровне являются основой для формирования прогнозов на уровне Саратовской области. Замысел прогнозного комплекса состоит в том, чтобы у исследователей имелась возможность в достаточно короткие сроки решать задачи комплексного социально-экономического прогнозирования как российской экономики, так и более узкие специальные задачи отраслевого и регионального развития.
При этом появляется возможность использования единого набора сценарных условия на всех уровнях построения прогноза.
Основное ядро системы моделей составляет межотраслевая модель CONTO. Прежде всего, необходимо отметить, что межотраслевая модель в основном используется для согласования отраслевого и макроэкономического уровней прогноза. Эта задача предполагает использование большого количества экзогенно задаваемых параметров, включая оценки целого ряда эластичностей, принципиальных для формирования сценариев.