Представления о генетической типологии были особенно глубоко развиты ученым при изучении кедровых лесов Дальнего Востока. Они составили основную идею его докторской диссертации и отражены в замечательном труде "Кедровые леса Дальнего Востока (М., 1956 г.), удостоенном премии АН СССР. Вокруг этой идеи исследователь собрал большой коллектив специалистов-лесоводов и развил ее практическую сторону, особенно на Урале, создав, в частности, единую типологическую классификационную сетку для лесных массивов Урала. В 70-х гг. вышла книга "Лесорастительные условия и типы лесов Свердловской области - практическое руководство" (Свердловск, 1974), в которой используется для описания лесных участков, кроме обычно присутствующей в лесотаксационном описании морфологической специфики, отражающей однородность участка в пространстве, также и характеристика происхождения и особенностей развития древостоя, отражающие однородность во времени. Это важнейшее требование генетического направления в типологии. В данном случае тип леса представляется в виде генетического ряда типов насаждений, сменяющих друг друга во времени. Тип леса генетических классификаций соответствует определенному типу лесорастительных условий, в связи с чем он оказывается единицей, как правило более крупной, чем в обычных, "естественных" по Колесникову, классификациях. Каждый тип леса имеет поэтому свой ареал, а генетические классификации всегда строго региональны. По данной причине классификация Колесникова предусматривает предварительную характеристику лесорастительных условий на конкретной географо-региональной основе, а каждый тип леса в своем описательном выражении предусматривает выделение коренных и производных насаждений.
На Урале, как и в ряде других районов страны, классификация Колесникова стала широко использоваться в лесоустройстве. Она сыграла свою роль в повышении уровня лесного хозяйства. Следует отметить, что ученый всегда очень активно включался в реализацию своих научных рекомендаций, сам и со своими последователями и учениками участвуя в практической работе лесоустроительных экспедиций. И теперь, через много лет, интерес практиков-таксаторов и тем более научных работников к этой весьма прогрессивной для лесного хозяйства части научно-практической деятельности Б. П. Колесникова не ослабевает.
3. Охрана природных ресурсов. В своих исследованиях растительных ресурсов, при изучении разнообразных природных комплексов страны на Востоке и особенно на Урале Б. П. Колесников, как ученый с широким кругозором и просто ценитель природных богатств, не мог обойти стороной проблемы сохранения природных уникумов и раритетов. Тем более что становление его как крупного научного деятеля совпало с тем временем, когда широкие круги общественности (не только научной) увидели масштабы катастрофического воздействия неразумной эксплуатации приходных ресурсов. В те далекие уже годы, после того как были залечены раны, нанесенные тяжелейшей войной, наша страна, ее наука получили возможность взглянуть трезво на проблемы охраны природы; появились и некоторые средства для их решения. Стали создаваться научные основы новой науки - экологии, которая имела прямое отношение к вопросам сохранения естественных сообществ, отдельных элементов живой и косной природы
В 50-х гг. в СССР возникло широкое движение в защиту природы. Оно развивалось по двум основным направлениям: общественное движение, где главную роль играло Всероссийское общество охраны природы и озеленения, и научно-академическое, решавшее разнообразные научные аспекты проблемы, и в первую очередь - сохранения уникальных природных объектов.
Академией наук СССР в 1955 г. была образована междуведомственная комиссия по охране природы на основе бывшей комиссии по заповедникам, а в филиалах академии стали создаваться региональные комиссии. Б. П. Колесников, очень активный по своей натуре человек, сразу же стал организовывать такую комиссию при Уральском филиале АН СССР. Это произошло в 1957 г. (первым председателем комиссии стал руководитель УФАН СССР Н.В. Деменев, а с 1959 г. ее возглавил Б. П. Колесников). Но после некоторого оживления природоохранной науки она понемногу стала иссякать, особенно в результате мероприятий по интенсификации использования природных ресурсов страны, которая вошла в противоречие с идеями заповедности и запрещения эксплуатации особо ценных природных объектов. В связи с этим и академическая природоохранительная наука постепенно стала свертываться. Прекратили свое существование центральная комиссия по охране природы и все региональные. Исключение составила лишь комиссия при УФАН СССР. Здесь сыграли роль личные качества ученого, который сумел удержать в составе комиссии многих видных уральских ученых и крупных руководителей органов власти. Комиссия до сих пор действует, уже 40 лет, хотя направления ее деятельности значительно изменились, в связи с появлением в последние десятилетия специальных государственных учреждений по охране природы, и прежде всего центрального ведомства при правительстве страны.
Комиссией проведена разнообразная работа по консолидации научных сил Урала, занимающихся природоохранительными исследованиями, по координации их, выбору направлений, по решению научно-практических вопросов, в том числе нередко и по прямым заданиям руководящих организаций уральских областей и республик. Не вдаваясь в многостороннюю деятельность комиссии, остановлюсь на одном очень важном направлении, которое с самого начала возглавил и вдохновлял Б. П. Колесников - создании системы охраняемых природных территорий. В 50-е гг. до начала работ комиссии на Урале существовало 6 заповедников, 14 заказников, около 120 памятников природы. Основная масса уникальных природных объектов еще не была выявлена, а известные не были взяты под охрану. Б. П. Колесников считал, что охраняемая часть природной территории должна покрывать сплошной сетью весь регион и занимать значительную площадь. По его плану на всей территории Урала начались исследования ученых-общественников по изучению уникальных объектов: лесных, степных участков, озер, геоморфологических образцов и т. п. За два десятилетия его руководства деятельностью комиссии на Урале были описаны до 600 памятников природы, восстановлены два заповедника, прекративших было свое существование в связи с кризисом заповедного дела в 50-е гг., - Висимский и Денежкин Камень, создан Средне-Уральский биогеоценологический стационар в первом из них. Эта деятельность сделала Б. П. Колесникова ведущим ученым страны в общей разработке фундаментальных проблем охраны растительности и в целом природных объектов. В 1968 г. ученый выступил с важным основополагающим докладом на I Всесоюзном совещании по охране растительных объектов в Ленинграде, он являлся руководителем секции охраны растительного мира на V Съезде ВБО в Киеве в 1973 г. и, наконец, в 1975 г. представлял природоохранную науку СССР на XII Международном ботаническом конгрессе.
Идеи исследователя о создании единых систем охраняемых территорий не исчерпали себя после отъезда его с Урала и после его кончины, но успешно реализовывались его коллегами и учениками. В настоящее время система особо охраняемых территорий Урала представлена 11 заповедниками, 5 национальными и природными парками, почти 2,5 тыс. памятниками природы.
4. Дендрология. Б. П. Колесников проявлял глубокую заинтересованность в проблемах экологии, биологии и систематики древесных растений. Этому, вероятно, способствовало и знакомство с крупнейшим систематиком растений В.Л. Комаровым, и его работа на Дальнем Востоке - в краях, тогда еще мало изведанных, с очень большим биологическим разнообразием растительного покрова, где и до сих пор совершаются крупные таксономические открытия. В первые же годы исследовательской работы он обратил большое внимание на такие важные лесные породы, как лиственница, кедр корейский, ива-чозения, тис, оригинальные дальневосточные березы, пихты и другие виды. В результате дендрологи получили ценные описания биологии, морфологии, ареалов целого ряда видов. Что касается систематики, то следует отметить прежде всего оригинальную работу по приморским лиственницам ("К систематике и истории развития лиственниц секции Pauciseriales Patschke". М., 1946). Он изложил новый взгляд на происхождение и взаимосвязь таксонов лиственниц Евразии, пересмотрел их классификацию, разделив род Larix на два цикла и пять рядов, описал детально морфологию и экологию лиственниц Приморья, выделил три новых таксона (лиственница охотская, Комарова, Миддендорфа). Не все высказанное исследователем впоследствии подтвердилось, но значительный стимул для дальнейшего познания систематики рода эта работа, несомненно, дала.
Но, пожалуй, более глубокими были работы ученого по биологии и экологии кедра корейского. Они явились плодом его многолетних исследований при подготовке докторской диссертации. Многие аспекты жизни этой интересной древесной породы, имеющей огромное значение для формирования таежных сообществ Дальнего Востока, были освещены им впервые. Он показал особенности вида Pinus korajensis как элемента живой природы и со всей полнотой охарактеризовал особенности лесных сообществ, слагаемых этой древесной породой, их структуру и динамику. Такая же полная картина экологии и биологии вида, его распространения с описанием характерных сообществ раскрыта им для чозении, в то время почти не изученной породы северных районов Дальнего Востока. Для пихты цельнолистной им также проведено крупное исследование вместе с М.Г. Васильевым.
При переезде на Урал ученый продолжал работать как дендролог и внес свой вклад в изучение хорологии главных лесообразующих пород этого региона.