Арктические пустыни и полупустыни занимают северную оконечность о. Котельный, острова Де-Лонга. Растительность располагается в депрессиях полигонально-трещиноватого или медальонно-пятнистого микрорельефа. По количеству видов и запасам фитомассы преобладают бриофиты, накипные лишайники и напочвенные водоросли. Сосудистые растения представлены 20-25 видами.
Арктические тундры подразделяются не две полосы. В северной полосе растительность занимает 50-60% поверхности, мощность живого слоя 5-10 см, В южной полосе покрытие увеличивается до 80-100%, высота до 15 см. Флора сосудистых растений становится богаче (до 125-130 видов), их роль в сложении растительных группировок значительно возрастает. В северной полосе преобладают кустарничково-травяные зеленомошные тундры с ивой полярной и лисохвостом альпийским, в южной - кустарничковые зеленомошные с ивой полярной, дриадой точечной, аулакомниумом вздутым, гилокомиумом аляскинским. В связи с термокарстом повсеместно развиты бугры, останцы-байджерахи с разнообразными кустарничковыми и травяными (осока прямостоящая, пушица Шейхцера) тундрами. Кустистых лишайников (тамнолия червеобразная, дактилина арктическая) крайне мало. Арктическая тундра особенно уязвима к антропогенным воздействиям и требует чрезвычайно бережного отношения. В дельте Лены создан крупный заповедник для сохранения тундры в естественном состоянии, чтобы иметь эталон по сравнению, с которым можно определять степень антропогенного изменения природы.
Субарктические тундры характеризуются дальнейшим увеличением разнообразия флоры (200-250 видов в элементарной флоре), усложнением структуры растительных сообществ, усилением мощности растительной дернины, значительной ролью кустарников, появлением единичных экземпляров древесной растительности в южной полосе тундр. Обширные площади занимают влагалищно-пушицевые кочкарные тундры. Значительно участие мелкобугорковых тундр, особенно к востоку от Индигирки, с доминированием брусники, голубики, багульника, дриады. Редко-кустарниковые тундры составляют важнейшую особенность субарктических тундр. Высота кустарников от 20-25 см в северной полосе, до 35-50 см в южной. Значительные площади лишайниковых тундр распространены в южной полосе. Они играют существенную роль в оленеводстве и очень чувствительны к антропогенным воздействиям. Повсеместно происходит делихенизация, для предотвращения которой необходима строгая регламентация выпаса оленей, запрещение в бесснежное время движения вездеходов и защита от пожаров.
Тундровые болота занимают обширные площади в равнинной тундре приморской низменности и на островах. Господствующее положение здесь занимают полигонально-валиковые тундроболотные комплексы, располагающиеся в речных долинах, дельтах, озерных котловинах. Их поверхность расчленяется сетью морозобойных трещин, в которых образуются ледяные клинья. Ширина валиков до 1 м и более, высота 20-40 см, они ограничивают пониженные полигоны площадью до 100 квадратных метров прямоугольной или шестигранной формы. На валиках тундровые группировки, в северных регионах с разнотравьем, осокой прямостоящей, ивой ползучей, мхами, в южных с пушицей влагалищной, кустарниками, кустарничками, лишайниками и мхами, близ границы леса здесь появляется лиственница. В полигонах - болота с осокой прямостоящей, пушицей узколистной, вейником незамечаемым, с видами родов дрепанокладус и сфагнум. На старых комплексах валики сильно разрастаются, полигоны приобретают корытообразную форму и часто бывают залиты водой.
В речных долинах и на морских побережьях кроме полигонально-валиковых тундроболот развивается специфическая для них растительность; по отмелям морских берегов, в устьях рек — приморские луга из бескильницы ползучей и осоки обертковидной, в поймах рек — злаково-хвощовые луга, заросли ив аляскинской, сизой, красивой и др., по берегам озер — заросли арктофилы рыжеватой. Обширная песчаная низина на Новосибирских островах (Земля Бунге), недавно освободившаяся от морских вод, в местах образования дюн покрыта единичными дернинками мятлика высокогорного и разнотравья.
Горы в тундровой зоне и высокогорья в таежной заняты каменистыми пустынями и горными тундрами. В пределах пояса каменистых пустынь большая часть поверхности покрыта безжизненными глыбами камня и щебнем, местами — эпилитными лишайниками (гематомма ветровая, ризокарпон географический, умбиликария северная), фрагментами высших растений (менее 5%). В верхних частях тундрового пояса обычны пятнистые тундры с алекторией бледноохряной, целокаулоном расходящимся, дриадой точечной, кассиопой четырехгранной, в сочетании с травяно-зеленомошными тундрами, в нижних — редкокустарниковые (береза тощая, ива красивая) с аулакомниумом вздутым, цетрарией клубочковой, влага-пищнопушицевые зеленомошные и лишайниковые цетрариево-кладиновые тундры. По склонам часты деплевые комплексы. Особенности горных тундр определяются также составом горных пород. На щелочных породах развиваются дриада мелкогородчатая, пухонос одноцветковый и другие растения. Большим флористическим своеобразием отличаются горные тундры Южной Якутии (рододендрон Адамса, кассиопа вересковая, филлодоце голубая). В горных тундрах имеются благоприятные условия для содержания оленей, особенно в летний период.
Бореальная растительность на территории Якутии представлена лесами: притундровыми, северотаежными, среднетаежными и горными. Для всех общей особенностью является развитие древесного яруса, большее или меньшее его влияние на остальные ярусы. Повсеместно во флоре преобладают бореальные виды. Господствующей породой в западной части является лиственница Гмелина, в восточном — лиственница Каяндера (граница между ними проходит по 120°-123° в.д.). Лиственничные леса (81,9 % лесопокрытой площади) в наибольшей степени адаптированы к холодным и влажным мерзлотным почвам, к резкоконтинентальному климату с суровой и продолжительной зимой. Сосновые леса ( 6,8 %) встречаются массивами, главным образом, в среднетаежной подзоне на более легких, сухих песчаных почвах. Темнохвойные леса с участием сибирской ели, кедра и пихты занимают менее 1% площади и встречаются в юго-западной и южной частях республики на более богатых и влажных почвах. Кедр и пихта доходят до 62° с. ш., сибирская ель по долине Лены и к западу от нее проникает до 71° с. ш., на северо-востоке ее нет. Заросли кедрового стланика, включаемые в лесопокрытую площадь, занимают около 6%. На долю лиственных лесов, в основном березовых, приходится немногим более 1% общей площади. Большая часть березовых лесов носит вторичный характер и временно занимает гари из-под лиственничных и сосновых лесов.
Притундровые леса представляют северный форпост и располагаются по границе с субарктической тундрой.
В западной части (бассейны рек Анабар и Оленек) полярная граница леса расплывчатая, часты редколесья, редины, лесные острова и отдельные деревья в безлесной тундре. В восточной части (в низовьях Яны, Индигирки. Алазеи, Колымы) граница более четкая. Притундровые леса характеризуются редкостойностью (сомкнутость крон обычно 0,2-0,3, высота деревьев порядка 10-12 м), более мощным развитием напочвенного покрова и травяно-кустарникового яруса, чем в настоящей тайге, и их сходством с ассоциациями субарктических тундр. Здесь обильны ива красивая и береза тощая (до 0,8-1,0 м высоты), брусника, голубика, багульник, аулакомниум вздутый, сфагны, цетрария клубочковая, нередко влагалищно-пушицевые кочкарники. Притундровые леса представляют полосу южной части субарктической тундры, заселенную лесом в современную эпоху. Это подтверждается и структурой древостоев. Нередко в пределах одного насаждения встречаются редкие искривленные деревья в возрасте 200-250 лет, образовавшие первые редины в тундре, и более стройные 60-70-летние деревья, сформировавшие под их защитой основной древостой. Полоса притундровых лесов аналогична лесотундре европейского и западно-сибирского севера, но отличается большей лесистостью, преобладанием лесных группировок над безлесными тундрами и болотами. Охрана притундровых лесов от рубок и пожаров — важная природоохранная задача.
Северотаежные леса занимают равнинные территории на огромных пространствах Якутии к северу приблизительно от 64" с.ш. От притундровых лесов их отделяют не очень четкие отличия; увеличение сомкнутости крон до 0,4-0,6, высоты деревьев до 15-18 м, уменьшение тундровых элементов в нижних ярусах. Преобладающая роль принадлежит лиственничным редкостойным лесам с березами тощей и растопыренной, ивами красивой и черничной, багульником, брусникой, зелеными и сфагновыми мхами. Часты деллевые комплексы с лишайниковыми (цетрария клубочковая, кладина лесная), редкостойными лесами. На северо-западе во втором ярусе нередко встречаются ель сибирская, ольховник кустарниковый. На месте сгоревших притундровых и северотаежных лесов развиваются вторичные пирогенные тундры с зелеными мхами и кустарниками.
Северотаежные леса к югу постепенно сменяются среднетаежными лесами. В переходной полосе шириной до 150-200 км в зависимости от рельефа могут соседствовать оба типа. Отличия между ними носят количественный характер, т.к. состав древесных пород и доминирующих видов в общем одинаков. Древостой в среднетаежных лесах более сомкнуты и производительны. Запасы древесины возрастают в среднем в 4-5 раз.