В 1999-2000 гг. многие бухарские евреи, после безуспешной попытки провести в кнессет свою партию «Лев», сделали шаг в сторону религиозной партии «ШАС», поддержав её на парламентских выборах в 1999 г. После успеха «ШАС» молодой лидер бухарских евреев Амнон Коэн стал членом кнессета и многие объединения бухарских евреев разных городов страны начали получать материальную поддержку благодаря усилиям этой партии. Под влиянием деятельности «ШАС», имеющей по всей стране отделения, в последние годы в жизни репатриантов последней волны религия стала занимать большее место.
Однако, со второй половине 2000 г., начала активно действовать среди бухарских евреев Израиля религиозная организация «Ор Авнер». За короткий срок в пол года, под её крылом были созданы религиозные общины бухарских евреев двух последних волн во многих городах страны. Объединение бухарских евреев Израиля и одновременно всех бухарско-еврейских общин диаспоры в единую организацию с разветвлённой структурой увенчалось созданием Всемирного конгресса бухарских евреев, учредительный съезд которого состоялся в торжественной обстановке в 2000 г. в Иерусалиме. Работа съезда проходила по пяти секциям. Выступления проходили на иврите, бухарско-еврейском и русском языках. На заключительном общем собрании съезд утвердил структуру конгресса, во главе которого стали президент и председатель, в их подчинении пять заместителей президента – президенты конгрессов в Израиле, Австрии и Германии, Северной Америке, Средней Азии, России. На последующей ступени иерархии заняли место – дирекция конгресса и президентский совет, куда были назначены 50 членов, в основном предприниматели. Дирекция осуществляет непосредственную работу, главными целями которой, по замыслу президента Л. Леваева, является достижение бухарскими евреями религиозного образования, создание и координация деятельности синагог, социальная поддержка, удовлетворение культурных запросов бухарских евреев – создание музея, поддержка общинных театров и газет.
Несколько бухарско-еврейских газет и журналов издавалось в Израиле ещё в конце 50-х - 70-х гг. ХХ века, а в 90-х гг. их было свыше 10 наименований. Как и прежде большинство из них просуществовало недолго. В настоящее время остались только две газеты: «Менора» и « Бухарская газета». Первая из них существует в основном благодаря поддержке Л. Леваева и имеет религиозное направление. «Бухарская газета» - издание светского направления, призванное удовлетворить духовные потребности бухарско-еврейской интеллигенции. Она в большей степени, чем другая газета бухарских евреев, затрагивает общеизраильские проблемы. Её издатель - Овадья Фатахов, глава вышеупомянутой партии «Лев», не преодолевшей на выборах в кнессет 1999 г. планку избирательного барьера. «Бухарская газета» выходит в основном на русском языке, лишь с отдельными страницами на бухарско-еврейском. Хотя в «Меноре» больше публикаций на иврите и бухарско-еврейском, в ней также используется в качестве основного русский язык. В отличие от этих газет периодические издания бухарских евреев в конце 50-х - 70-х гг. выходили в основном на бухарско-еврейском языке с отдельными заметками на иврите. Таким образом, доля русского языка в периодике бухарских евреев в Израиле за минувшее десятилетие значительно увеличилась, что является отражением его усилившейся роли в жизни бухарских евреев Средней Азии.
Бухарские евреи в Израиле, как и в странах диаспоры, хотя и в меньшей степени, пытаясь сохранить своё этническое и семейное наследие, особенно широко в последнее десятилетие, занялись книгоизданием на русском, бухарско-еврейском и иврите. В этом, они, видимо, опережают другие неашкеназские еврейские этнические группы из бывшего СССР. Больше всего издаётся книг, посвящённых истории своих семей. Число этих книг, часто издаваемых очень ограниченными тиражами, перевалило за пол сотни. Израиль занимает первое место и по количеству изданий бухарскими евреями книг посвящённых их поэзии, истории и фольклору. В течение 90-х гг. вышло несколько десятков таких книг.
Америка
Эмиграция бухарских евреев в Северную и Южную Америку началась ещё в 40-50 гг. XX века. Первыми эмигрантами были бухарские евреи из Западной Европы и Израиля. Небольшая их часть осела в Аргентине и Бразилии, а большинство поселилось в США. К началу 70-х гг. количество бухарских евреев в США достигло тысячи. В 70-х и 80-х гг. из Израиля и СССР прибыло туда около двух тысяч, а в 90-х гг. из Израиля и в основном из СССР-СНГ ещё 19 тысяч бухарских евреев. США находится сегодня на втором после Израиля месте в мире по числу бухарских евреев, количество которых достигло 25 тысяч. Они проживают в больших городах США, таких как Нью-Йорк (70% из них в районе Квинса, составляя там самую большую концентрацию бухарских евреев в Америке), Кливленде, Чикаго, Лос-Анжелесе, Сиэтле, Деневере, а также в городах Техаса, Аризоны и Флориды.
Несмотря на то, что число бухарских евреев в США меньше, чем в Израиле, они до последнего времени были более активны, так как туда прибыло большее количество образованных и состоятельных бухарских евреев. На новом месте они сумели быстро сорганизоваться, создав свои общинные, религиозные и культурные центры, среди которых Бухарско-еврейский раввинский совет, Американская организация бухарских евреев – ветеранов войны, Бухарско-еврейский спортивный клуб, танцевальные и музыкальные ансамбли, а также четыре театра («Возрождение» и «Бухара на Гудзоне», Театр Ильяса Малаева, Театр-студия), которые ставят спектакли в основном на бухарско-еврейском языке. Бухарские евреи открыли синагоги в: Нью-Йорке, Атланте, Филадельфии, Фениксе, Сан-Диего, Кливленде, Денвере, Бостоне, Сиэтле, Майами и других. В США бухарские евреи регулярно устраивают конгрессы и издают на русском языке: газеты «Мост» и «Замон», журналы «Дружба», «Восход» и «Надежда». Несмотря на то, что большинство бухарских евреев живут, как и прежде, в тесной связи друг с другом, их внутренний семейный уклад быстро меняется под влиянием внешних условий. Одним из наиболее ярких проявлений их стремительной модернизации в Америке является частое изменение фамилий, звучащих по-бухарско-еврейски и по-русски (т.е. с окончаниями -ов, -ев), путём отказа от русифицированных окончаний и нередко американизацией корня фамилии. От русских окончаний в фамилиях отказывались в 70-90-х гг. бухарские евреи и в Израиле, но это происходило гораздо реже. Мотивация различна. Если в США бухарские евреи не хотят, чтобы воспринимали русскими, то в Израиле они стеснялись своей принадлежности к бухарским евреям. Личный успех Льва Леваева и деятельность среди бухарских евреев посредством упомянутого Конгресса способствуют усилению бухарско-еврейской самоиндификации в Израиле.
В Америке процесс модернизации особенно быстро протекает у бухарско-еврейской молодёжи, которая здесь, также как и в последние пол века в Средней Азии, карьеру выбирает по двум основном направлениям – бизнес и образование. Вообще в США бухарские евреи считают светское образование большей ценностью, чем в Израиле. Поэтому больший процент молодёжи там учится в ВУЗах. Опасаясь утраты молодёжью связи с еврейской традицией в светских учебных заведениях, вышеупомянутая организация «Ор Авнер» с 2000 г. развернула свою деятельность среди бухарских евреев и в Северной Америке. Её главной задачей здесь является создание для них религиозной системы образования. С общинами бухарских евреев США тесно связаны общины Канады.
Туда отдельные семьи бухарских евреев приехали ещё в 30-80-х гг. ХХ века, хотя основная их масса эмигрировала из Израиля и США во второй половине 90-х гг. К концу столетия там оказалось около тысячи бухарских евреев. К настоящему времени они уже наладили общинную жизнь в нескольких городах, особенно в Торонто. Там они организовали свою синагогу, в которую был передан один из шести древних свитков Торы, вывезенных из Узбекистана в сентябре 1999 г. руководством Конгресса бухарских евреев США и Канада с согласия президента этой страны И. Каримова. Канадские организации бухарских евреев объединились с их организациями в США в 1999 гг. на общем съезде.
Европа
Первым европейским городом, в котором поселились бухарские евреи, стала Москва. Их община начала формироваться там ещё в последней четверти века XIX века, когда в городе поселились представители крупных торговых фирм бухарских евреев, занятые закупками мануфактуры у московских текстильных фабрикантов и продажей им хлопка. В советские годы бухарские евреи поселились и в других городах европейской части СССР. В 1989 г. там проживало 1546 бухарских евреев (в том числе 1407 в России и 110 на Украине). Сегодня основная их масса, около 1000 человек, проживает по-прежнему в России, в том числе приблизительно 500 бухарских евреев в Москве.
В Западной Европе бухарские евреи поселились в начале во Франции. После революции в России прибыли сюда в 20-х гг. несколько десятков бухарских евреев. Часть из них успели до прихода нацистов эмигрировать в Лондон. К 1940 г. проживали здесь, в основном в Париже, около 200 бухарских евреев. Четверть из них погибли в Аушвице, однако, большинство спаслось, после того как представителю бухарских евреев Асафу Ачильдиеву удалось убедить немцев в том, что они иранцы, верующие в Моисея. После войны во Франции осталась небольшая часть бухарских евреев. Многие уехали в США, Израиль и другие страны.
В Центральной Европе бухарские евреи живут сегодня в основном в Вене. Первые три семьи из Средней Азии остались в этом, транзитном тогда, городе на пути из СССР в Израиль в конце 1973 г. вследствие известий о трудностях абсорбции и войны Судного дня. К концу 70-х гг. число бухарских евреев в городе выросло до 150 семей за счёт эмигрантов из СССР и из Израиля. В конце 80-х гг. количество их семей в Вене достигло 250. Сегодня проживают в городе более 350 семей бухарских евреев, которые составляют примерно 2000 человек. Эмигрировав в Австрию, бухарские евреи продолжают соблюдать еврейские обычаи. С помощью движения Хабад они основали в 1981 г. в Вене Талмуд-Тору. Хабад помог им организовать соблюдение кашрута и других еврейских традиций, таких как брит-мила, похороны, свадьбы. В 70-х и 80-х гг. бухарские евреи посещали синагоги ашкеназов в Вене, однако в 1988 г. они, подобно своим собратьям в США и Израиле, начали строительство собственной синагоги. В 1992 г. эта синагога открылась. К 2000 г. венская община бухарских евреев организовала школу искусств и выпуск собственного журнала на русском языке «Венская община».