Из млекопитающих эндемичен монотипный (некоторые авторы полагают, что речь может идти о двух видах) отряд шерстокрылых, а также семейства тупай, лоризид и гиббоновых, монотипные роды человекообразных обезьян орангутанов и индийских слонов. Из птиц имеется лишь одно эндемичное семейство листовковых. Это центр возникновения и разнообразия форм фазановых, рогоклювых, питтовых, белоглазковых. В фауне пресмыкающихся эндемичны безухие вараны, щитохвостые змеи, гавиаловые крокодилы и, может быть (в зависимости от понимания объема этого семейства) лучистые змеи.
Эндемичных родов земноводных много (летающие лягушки, узкоротые лягушки и др.), эндемичных семейств нет. Имеются четыре эндемичных семейства рыб. Это центр разнообразия таких широко распространенных групп рыб, как карпообразные и сомообразные.
Ряд семейств и отрядов роднят фауну Ориентального царства с фауной Афротропиков. Таковы человекообразные обезьяны, носороги, слоны, полуобезьяны, птицы-носороги, нектарницы, ткачиковые. В Малайской и особенно Тихоокеанской области резко сказываются островные черты биоты: высокий эндемизм, обеднение флоры и фауны.
В Ориентальном царстве выделяют четыре области.
- Афротропическое (Эфиопское царство). Биота Афротропического царства связана с биотами Мадагаскарского и Ориентального царств весьма широко и издавна. Связи с Палеоарктической частью Голарктического царства менее тесные, но переходная область весьма широкая. Что касается Капского царства, территориально примыкающего к Афротропическому с юга, то значительная общность прослеживается только в более молодых группах фауны (птицы и млекопитающие), древние компоненты фаун и флор весьма различны.
Пять (по А. Л. Тахтаджяну, 1973) эндемичных семейств имеются во флоре сосудистых растений Конголезской области. Для Калахари-Намибской области; характерно голосеменное растение из отряда гнетовых вельвичия, принадлежащее к монотипному семейству вельвичиевых.
Значительно более высок эндемизм на родовом уровне: 25 эндемичных родов растений обитают в Суданской области, 5 - в Атлантической области, кроме того, ряд родов представлен в этих областях; их насчитывается 22. Высокий родовой эндемизм отмечается и на острове Святой Елены. Ряд родов Афротропического царства роднит его флору с флорой других областей. Таковы акации, распространенные в Неотропическом царстве, на юге Неарктической части Голарктики, в Ориентальном царстве, на островах Тихого океана. Основной центр их распространения в Австралийском царстве, где они широко представлены группой филлодийных акаций, у которых листовая пластинка заменена уплощенным листовидным черешком и 0ллодием. Баобабы встречаются в Афротропическом, Мадагаскарском царствах, а один вид - в Северной Австралии. Имеются и связи современной афротропической флоры с флорой Капского царства.
Афротропические рыбы включают ряд эндемичных семейств, хотя многие виды выходят за пределы царства в низовьях Нила (доходят до его устья). Связи с Неотропическим царством наблюдаются в семействе харациновых рыб, богато представленном (более 100 видов) в Афротропическом царстве, преимущественно в бассейне Конго, но имеющем центр разнообразия в Неотропическом.
Пантропическое семейство цихлид имеет центр разнообразия в Афротропическом царстве, а три вида двоякодышащих рыб родственны южноамериканскому лепидосирену и австралийскому неоцератоду. Эндемичны отряд клюворылых, представленных двумя семействами с более чем 100 видами, и отряд многоперых с одним семейством и двумя родами. В Афротропическом царстве имеются представители пантропического отряда безногих земноводных, из бесхвостых - семейство пиповых роднит фауну Афротропического царства с фауной Неотропического, а семейство веслоногих лягушек имеет здесь центр разнообразия более 200 видов. Эти виды объединяются в роды, как эндемичные, так и общие с Капским и Мадагаскарским царствами. Здесь же находится центр разнообразия настоящих лягушек, квакши отсутствуют. Из пресмыкающихся здесь центр разнообразия сухопутных черепах. Семейство пеломедузовых черепах общее с Неотропическим царством. Среди ящериц и змей наблюдается значительная общность с Ориентальным и Неотропическим царствами. Широко представлены семейства гекконовых, агамовых, сцинковых, настоящих ящериц и варанов, обычных и для других царств Восточного полушария.
То же касается и змей, среди которых аспидовые представляют пантропическую группу, узкоротые связывают Афротропическое царство с Неотропическим, а питоновые с Ориентальным царством. Из трех видов крокодилов два эндемичны. Фауна птиц включает 67 семейств, большая часть которых имеет широко распространенные или общие с Голарктическим и Ориентальным царствами формы. Имеются два эндемичных отряда африканские страусы один вид и птицы-мыши шесть видов, а также четыре эндемичных семейства: китоглавые (один вид), птицы-секретари (один вид), тураковые (пять родов и 13 видов), лесные сорокопуты (три рода с девятью видами). Афротропическое царство центр разнообразия медоуказчиков, птиц носорогов, ткачиков и нектарниц.
Из млекопитающих эндемичны монотипный отряд трубкозубов, семейства шипохвостых (три рода, десять видов), бегемотов (два рода, два вида), жирафов (два рода, два вида), выдровых землероек (три вида). Огромно число видов полорогих, в том числе различных подсемейств антилоп, из которых отдельные виды выходят в Капское царство, на юг Голарктики и в Ориентальное царство. Связи с Ориентальным царством разнообразны: ящеры, или панголины, слоны, носороги, из видов лев, леопард, гепард, каракал, полосатая гиена, обыкновенный шакал, медоед и др., частично заходящие и в южную часть евроазиатского сектора Голарктики.
Семейство ламантинов связывает пресные воды Африки с Амазонкой. Златокроты (около 20 видов) и монотипное семейство долгоногов встречаются и в Капском, и в Афротропическом царствах. Таким образом, более молодые связи в биоте Афротропического царства прослеживаются с Ориентальным и Голарктическим (в его евразийской части) царствами, а более древние с Неотропическим. Что касается Капского царства, то, как было сказано, древние компоненты фаунистического и флористического комплексов оказываются разными, а более новые таксоны различного порядка общими благодаря существующей в настоящее время открытой наземной границе.
В Афротропическом царстве выделяют области: Суданскую, Конголезскую, Калахари-Намибскую и Атлантическую (острова Святой Елены и Вознесения).
- Мадагаскарское царство. Оно охватывает остров Мадагаскар, Маскаренские, Сейшельские, Амирантские, Коморские острова. Из представителей различных таксонов, обитающих в Мадагаскарском царстве, одни реликты ранее широко распространенных групп, другие наследие более новых связей с Афротропическим и Ориентальным царствами, существовавших до четвертичного периода.
Во флоре царства насчитывается шесть-девять эндемичных семейств цветковых растений, число эндемичных родов составляет не менее 450, а из примерно 3500 сосудистых растений эндемичны более 30 %, в том числе цветковых около 39 %.
По числу видов первое место среди семейств занимают орхидные (более 900 видов). Из эндемиков следует упомянуть сейшельскую пальму с крупными плодами-двойняшками и «дерево путешественников», принадлежащее к роду, второй вид которого, иногда относимый к особому роду, встречается в Гвиане и северной Бразилии.
Немногочисленные пресноводные рыбы имеют в основном эфиопское происхождение. Из сухопутных черепах эндемичны маленькая паучья черепаха и гигантская, ныне сохранившаяся только на островах Альдабра (Индийский океан). Из пеломедузовых черепах, представленных в Мадагаскарском царстве тремя родами, имеется один мадагаскарский вид, остальные семь видов обитают только в Южной Америке. Сюда не проникают агамы, вараны и обыкновенные ящерицы, но имеются два эндемичных рода игуан, центр разнообразия которых лежит в Неотропическом царстве, а также эндемичный род гекконов с шестью видами.
Отмечается наибольшее разнообразие хамелеонов не только на видовом, но и на родовом уровне. Полностью отсутствуют ядовитые змеи и характерные для Палеотрописа питоны; присутствуют два вида, близких к южноамериканским удавам, мадагаскарский удав и мадагаскарский древесный удав.
В историческое время (вероятно, не более 150 лет тому назад) вымерли эпиорнисы, выделявшиеся в эндемичный отряд (насчитывалось не менее девяти видов).
Из птиц для царства характерны шесть эндемичных семейств: мадагаскарские пастушки - два рода и три вида; дронтовые; два рода, три вида которых были истреблены в XVII в. филепиттовые - два рода и вида; монотипичное семейство красноклювых поползней; и ванговые - девять-одиннадцать родов с 11-14 видами. Отсутствуют такие широко распространенные группы, как синицы, овсянки, сорокопуты, настоящие вьюрки.
Из примитивных форм млекопитающих особенное разнообразие имеют полуобезьяны, в числе которых эндемично семейство лемуров с 6 родами и 16 видами, семейство индри с тремя родами и четырьмя видами и монотипное семейство руконожек.
Представители семейства тенреков из насекомоядных, насчитывающего девять родов и 28 видов, реликты ранее широко распространенной группы, которую некоторые систематики объединяют в одно семейство с афротропическими водяными землеройками. Ныне они встречаются только на Мадагаскаре и Коморских островах, относительно близки к щелезубам Антильских островов. Из летучих мышей единственный представитель эндемичного семейства мадагаскарских присосконогов имеет ближайших родичей американских присосконогов (два вида семейства в Центральной и на севере Южной Америки).