Реорганизовав армию (насчитывавшую 20 тыс. человек), коммунисты обратили оружие против своих соперников. Антикоммунистические фракции, которым недоставало сплоченности, целеустремленности, дисциплины и оружия, обратились за помощью к прогерманскому правительству в Тиране и тем самым окончательно себя дискредитировали. К середине лета 1944 коммунисты разгромили остатки балыстов в Южной Албании. Когда в конце июля они вошли в Центральную и Северную Албанию, то столкнулись лишь с незначительным сопротивлением националистов. Особую проблему представлял район Мирдиты, где практически отсутствовала какая-либо центральная власть и господствовали "законы гор". Коммунистам здесь пришлось вести борьбу с вооруженными отрядами байрактаров, местной родовой феодальной знати, образовавшей в октябре 1944 собственное правительство ("Лига Шкодры").
В октябре 1944 началось отступление немцев из Албании.20 октября 1944 в Берате Антифашистский национально-освободительный комитет был преобразован во Временное демократическое правительство во главе с Э. Ходжей. Спустя несколько дней был упразднен марионеточный Регентский совет. При поддержке союзников 17 ноября 1944 НОА вошла в Тирану, а 28 ноября завершила освобождение Албании. Однако на этом война не была закончена. В конце 1944 отдельные бригады албанской НОА совместно с Народно-освободительной армией Югославии принимали участие в освобождении Черногории и подавлении сопротивления албанских националистов в Косово. В течение нескольких лет в горных районах Севера действовали отряды монархистов и байрактаров.
Албания в период коммунистического режима. После освобождения Албании новое руководство приступило к масштабным реформам, направленным, прежде всего, на укрепление позиций государства в экономике. Устанавливался государственный контроль над промышленными предприятиями и акционерными обществами, принадлежавшими иностранным и местным владельцам; конфисковывалась собственность политэмигрантов; национализировалась иностранная собственность и банки; реквизировались транспортные средства и автомастерские. В деревне новая политика предусматривала проведение аграрных реформ. В соответствии с законом от 29 августа 1945, государственные земли и вся земельная собственность, конфискованная у крупных землевладельцев, кулаков и религиозных учреждений, подлежала разделу среди крестьян. Национализировались крупные скотоводческие хозяйства. В последующие два года в собственность государства перешли почти все промышленные и торговые предприятия. Была установлена монополия на внешнюю торговлю и государственный контроль над внутренней торговлей.
Коммунисты пытались узаконить свое правление путем проведения 2 декабря 1945 выборов в Учредительное собрание. Контролируемый коммунистами Демократический фронт Албании, преемник Национально-освободительного фронта, получил 93% голосов избирателей.11 января 1946 Народное (Учредительное) собрание провозгласило Албанию республикой, а 14 марта того же года приняло конституцию Народной Республики Албании (НРА). Правительство страны возглавил Энвер Ходжа.
29 апреля 1946 титоистская Югославия первой признала коммунистическое правительство, ее примеру 10 ноября последовал СССР. Великобритания и США готовились признать новое албанское правительство при условии участия в нем и оппозиционных политических партий. Однако этого не произошло, и миссии Великобритании и США были отозваны из Тираны. В августе 1946 Англия и США противодействовали принятию Албании в ООН, и только 15 декабря 1955 в результате соглашения между Востоком и Западом Албания стала членом этой организации.22 октября 1946 два английских эсминца получили тяжелые повреждения от мин, незадолго до этого установленных в проливе Керкира. Хотя мины были заложены в албанских территориальных водах, этот пролив считался международным. Албания отклонила требования Англии о компенсации ущерба, а также решение Международного суда в Гааге о выплате Англии ок.2,4 млн. долл. С конца 1946 Албания оказывала помощь греческим коммунистам, которые вели партизанскую войну в своей стране. Не было выполнено требование Генеральной ассамблеи ООН 27 ноября 1948, чтобы Албания прекратила оказание этой помощи. В свою очередь, албанские власти возмущались притязаниями Греции на южные районы Албании.
В 1948 в Албании разразился серьезный внутренний конфликт. Для укрепления обороны страны и осуществления амбициозных планов индустриализации и модернизации требовалась финансовая и военная помощь. Эту функцию взяла на себя Югославия. Шесть экономических соглашений, заключенных в период с июля 1946 по июнь 1947, увенчались образованием смешанных компаний, прибытием югославских специалистов и военных советников и получением из Югославии оборудования и субсидий. Руководство Албании обсуждало вопрос об объединении с Югославией и Болгарией в составе Балканской федерации либо о вхождении Албании в Югославию в качестве союзной республики. На Пленуме ЦК КПА, состоявшемся в конце февраля - начале марта 1948, было принято решение об интеграции военной и экономической инфраструктуры двух стран.
Ситуация резко изменилась, когда 28 июня 1948 контролируемое СССР Информационное бюро коммунистических и рабочих партий (Коминформ) обрушилось с грубыми нападками на Югославию. Албания немедленно расторгла экономические соглашения с этой страной и выслала югославских советников. В ответ Югославия в 1949 расторгла Договор о дружбе с Албанией. В ноябре 1950 дипломатические отношения между обеими странами были разорваны. Они были восстановлены только 21 декабря 1953. Энвер Ходжа и его сторонники также свели счеты с влиятельной проюгославской группировкой в Албанской партии труда (так с ноября 1948 стала называться партия коммунистов). Особым нападкам подвергся Кочи Дзодзе, главный соперник Ходжи, который был министром внутренних дел, а также оргсекретарем Центрального комитета партии. В 1948 Дзодзе был арестован как последователь Тито, а в 1949 казнен. Политические чистки т. н. "титоистов" и "троцкистов" происходили и в 1950-1952. Они затронули 14 из 32 членов ЦК АПТ и 32 из 109 депутатов Народного собрания. Всего из партии к весне 1952 было "вычищено" 28 тыс. членов, или более половины ее состава. Многие албанцы, спасаясь от арестов, бежали из страны. В обществе насаждался культ личности Сталина и Ходжи.
Югославское влияние сменилось советским: в 1949 37% бюджета Албании составляли поступления от СССР и его союзников. В 1949 Албания была принята в члены Совета Экономической Взаимопомощи (СЭВ). Несмотря на сложные экономические проблемы, Ходжа не только удержал власть, но и упрочил ее, сосредоточив в своих руках (с июля 1950) посты руководителя партии и главы правительства, а также министра национальной обороны и министра иностранных дел.
Смерть Сталина в 1953 и политика Н.С. Хрущева, направленная на разоблачение "культа личности" Сталина и улучшение отношений с Югославией, вынудили Ходжу резко изменить курс. Следуя советской модели управления, Пленум ЦК АПТ, состоявшийся в июле 1954, утвердил принцип коллективного руководства. Согласно решению Пленума, правительство возглавил Мехмет Шеху, выходец из военных кругов. Ходжа сохранил за собой пост первого секретаря ЦК АПТ.
В середине 1950-х в различных слоях общества стало нарастать недовольство политикой АПТ. Звучали резкая критика в адрес партийного руководства, выдвигались требования пересмотра политических процессов 1948-1949, восстановления внутрипартийной демократии и реабилитации невинно осужденных. Хотя в 1955-1956 сторонники Сталина утрачивали свои позиции в социалистических странах Европы и Тито требовал отстранения Ходжи, последнему удалось удержаться на своем посту, апеллируя, кроме всего прочего, к националистическим чувствам и призывая бороться с растущей угрозой югославского господства. Предпринятая в этот период попытка либерализации и борьбы с "культом личности" закончилась новыми чистками и политическими процессами. Под влиянием событий в Венгрии и Польше в 1956 Ходжа возобновил острую полемику с югославским руководством, обвиняя его в подрыве мирового коммунистического движения. Восстанавливался культ личности Сталина. В общество был вновь вброшен тезис о том, что Албания находится в "капиталистическом и ревизионистском окружении".
Разрыв албано-советских отношений. В 1957-1959 значительно увеличилась экономическая помощь из КНР, а с октября 1959 албанская печать заняла четкую прокитайскую позицию.24 июня 1960 албанская делегация на международной встрече представителей коммунистических и рабочих партий в Бухаресте выступила с осуждением политики СССР в отношении Запада. В довершение Ходжа выступил на международном Совещании представителей коммунистических и рабочих партий в Москве в ноябре 1960 резко осудил политику Хрущева.
В ответ Москва пошла на разрыв экономических отношений, отменив программы помощи и приостановив выделение кредитов. Из Албании были отозваны советские специалисты, а албанские студенты лишались права продолжить обучение в СССР. В марте 1961 было принято решение о ликвидации советской базы ВМФ во Влёре. Окончательный раскол между коммунистами Албании и СССР произошел на 22 съезде КПСС в октябре 1961, когда Хрущев предал гласности суть противоречий между обеими странами. В декабре были разорваны дипломатические отношения Албании и СССР. Из Албании отозвали персонал советского посольства и торгпредства, а в Москве закрыли посольство и торгпредство Албании. В том же году этим воспользовались китайские коммунисты, которые предоставили Албании кредит на сумму 125 млн. долл. на развитие промышленности и направили в эту страну своих технических специалистов и советников.