Второй участок охватывает предгорья и долины рек Киевки, Черной и их притоков, характеризуется пологими горными склонами.
В пределы третьего участка входит среднегорный (от 400 до 900 метров) рельеф хребта Заповедного, где преобладают пологие и средней крутизны склоны. Часты выходы легкоразрушающихся коренных пород продуктами выветривания, которых образованы делювиальные и элювиальные отложения, иногда достигающие мощности более десятка метров.
Четвертый участок приурочен к высоте более 900 метров над уровнем моря. Он включает природоразделительную и водо-разделительную части хребта Заповедного. Здесь много выходов плотных коренных пород. Крутизна склонов иногда превышает 400 , хорошо выражены альпийские формы рельефа. В удаленной от моря северной части заповедника, например в бассейне верхнего течения Киевки зима сравнительно суровая и многоснежная. Средняя температура января –190 - -200, абсолютный минимум температуры воздуха на поверхности почвы достигает -450. В конце октября – начале ноября в горах ложится устойчивый снежный покров, мощность которого к концу февраля достигает 50 – 60 см., а в горных котлованах и других закрытых от ветра местах превышает 1 метр. Весна наступает во второй половине марта. Благодаря большому количеству солнечных дней (за март – май в среднем 20-25) и быстрому нарастанию положительных температур воздуха снег сходит быстро. Лишь в верхнем поясе хребта Заповедного, где заморозки могут наблюдаться во второй половине мая, в узких тенистых распадках до середины мая встречаются остатки нерастаявших наледей. Лето тёплое, среднемесячная температура в июле и августе 190 – 200. Со второй половины сентября возможны осенние заморозки, а уже с первой половины октября вершины гор белеют от раннего снега. Среднегодовая температура воздуха «континентальной» части заповедника 2.40 – 2.70 . Средняя продолжительность безморозного периода составляет 105 – 125 дней, вегетационного 150 – 160 дней. В год выпадает 700 – 800 мм осадков.
В приморской полосе зима более мягкая, малоснежная. Средняя температура января –110 - -120 , абсолютный минимум -300. Хотя весна здесь наступает значительно раньше, чем в горах, нарастание температуры воздуха происходит значительно медленнее. Из – за частых туманов и влияния охлажденного за зиму моря количество дней с солнечным сиянием в 2-3 раза меньше, чем на участках, лежащих за хребтом Заповедным.
Фенофазы развития растительного мира на побережье по сравнению с глубинными районами запаздывают на 1,5-2 недели. Бывает, что в конце мая – начале июня, когда на побережье туманно, прохладно и сыро и еще не развернулись полностью листья у бархата амурского, ореха маньчжурского, клёнов и ясеней, на континентальных склонах хребта Заповедного светит яркое солнце, буйно цветет растительность и созревает земляника. Лето в прибрежной части заповедника так же более прохладное, пасмурное, влажное, чем в глубинной зоне. Температура самого теплого месяца – августа на побережье на 2 – 2,50 ниже, чем в верхнем течении Киевки.
На низких водоразделах (до 250-300 метров над уровнем моря) встречаются особые перегнойные почвы. По северному склону эти почвы занимают полосу 100 – 150 метров от водораздельной линии, а по южному 30 – 50 метров. Для хвойно-широколиственных лесов центральной части заповедника характерны сырые горно-лесные почвы, имеющие слабокислую или кислую реакцию среды. На пологих склонах, где водоснабжение затруднено, а дренаж ослаблен, развиваются горно-лесные оподзоленные почвы. Эти почвы приурочены к горным хвойно-широколиственным лесам на высоте 500-600 метров над уровнем моря. Для них отмечены накопления кремнезёма в верхних горизонтах. На подпочвенных террасах в среднем течении рек под хвойно-широколиственными и широколиственными лесами развиты бурые лесные почвы на аллювиальных отложениях. Эти почвы хорошо дренированы, имеют слабокислую реакцию и высокую степень начинённости основаниями, в результате чего производительность растущих на них лесов характеризуется высокими показателями.
Задернованные иловато – гелевые почвы приурочены к пониженным слабодренированным участкам высокой поймы. Эти почвы обладают большим потенциальным плодородием, так как богаты азотом и для них характерна слабокислая реакция.
На узких скалистых водоразделах и крутых склонах на высоте 800 метров над уровнем моря и более, где часты выходы коренных плотных пород, развиты лишь примитивные фрагментарные почвы. Водный режим неустойчив. К данным участкам обычно приурочены заросли подгальцевых кустарников и низкопроизводительные, высокогорные леса.
В этом низкогорном поясе преобладают леса из дуба Монгольского проникающие вглубь материка на 6-8 километров. Растительность этого пояса испытала мощное влияние хозяйственной деятельности человека, и особо систематических лесных пожаров. Первичных лесных группировок не сохранилось, а семенные высокоствольные широколиственные леса в большинстве случаев сменились порослевыми, низкопроизводительными дубняками и древесно-кустарниковыми зарослями. Распространены так же кустарниковые заросли лощины разнолистной. Вторичные луга и каменные осыпи покрыты лишайниками.
Изредка сохранившиеся отдельные деревья и небольшие группы кедра корейского и пихты дельтолистной выполняют роль семенщиков, и в условиях заповедного режима появляется и успешно растёт подрост и молодняк этих хвойных пород. На крутых южных и западных склонах на месте выгоревших кедровников произрастают сухие дубняки с марьяниковым покровом порослевого происхождения. Возобновление дуба порослью гнёздами вокруг стволов протекает быстро, обеспечивая групповой подрост, а затем и древостой. Хорошо возобновляется кедр. Это приведёт со временем к смене дубняков дубово-кедровыми древостоями. Современные древостои из дуба монгольского высотой до 10-15 метров с единичной примесью кедра или березы маньчжурской. Сомкнутость древостоя до 0.7. Занос стволовой древесины в возрасте 80-100 лет составляет 70-120 м3/га. Древостой сообщества двухъярусные, разновозрастные (от молодняков до перестойных
крупноствольных). В Древостоях господствует дуб. Иногда в виде редкой единичной примеси встречаются: в верхней пологе – березы - маньчжурская и жёлтая, липа амурская, ясень маньчжурский, кедр, клён мелколистный, бархат. Верхний полог обычно разрежен, высота его 10-22 метра при диаметре стволов дуба 30 – 70 см., это крупные единичные деревья. Реже верхний полог имеет большую полноту и сомкнутость его достигает 0.5-0.6. Нижний полог более сомкнут – до 0.9. Высота нижнего полога 3-10 м при диаметре стволов дуба 10-20 см. Занос стволовой древесины в 120-140 лет составляет 150-250 м3. Во многих насаждениях отмечено возобновление дуба, берёзы маньчжурской, клёна мелколистного; в некоторых случаях липы амурской, ясеня; возможен довольно обильный подрост кедра. Дубняки широко распространены в заповеднике. Приурочены к среднекрутым и пологим горным склонам всех экспозиций, к широким платообразным водоразделам и к хорошо дренированным участкам подпойменных террас. Почвы бурые горно-лесные, хорошо дренированные. В дубняках регулярно, через 2-3 года бывают хорошие урожаи желудей, представляющие прекрасную кормовую базу для кабанов, гималайских медведей и других диких животных.По особенностям местообитания (главным образом по условиям движения и почвенного плодородия), производительности и общности главной лесообразующей и сопутствующих древесных пород в заповеднике выделены три основные группы типов кедровников:
- Сухие;
- Свежие;
- Влажные;
Сухие кедровники приурочены к гребням скалистых водоразделов и прилегающим к ним преимущественно южных экспозиций. Встречаются они и на окраине каменистых осыпей, а также на участках изобилующих выходом коренных пород. Почвы бурые горно-лесные, маломощные.
Свежие кедровники встречаются на крутых и среднекрутых склонах всех экспозиций. Почвы бурые горно-лесные, скелетные, хорошо дренированные, устойчивые по гидрологическому режиму. Древесный полог двухъярусный, разновозрастной, сомкнутый. Зона стволовой древесины достигает 350-400 м3. В древостое помимо кедра обычны липа амурская, берёза желтая и клён шелколистный. Подлесок образован многочисленными видами кустарников с преобладанием лещины маньчжурской и элеутерокока колючего. Из лиан развиты актинидии коломикта и острая, виноград и лимонник. Так же разнообразен по видовому составу и травяной покров, основу которого составляют шиповник Буша, кочедыжники, фрина тонкокистевая.Влажные кедровники распространены широко, но занимают незначительную площадь и встречаются небольшими участками на надпойменных террасах, шлейфах и нижних частях горных склонов, а так же на концах выносов. Почвы бурые, лесные, мощные, глубоко гумусированные, влажные.
Весьма интересные по флористическому составу и строению кедровники имеются на о-во Петрова. В составе их древостоев участвуют тис, граб и липц. Тис отлично возобновляется, и его жизнеспособный подрост местами образует густые заросли. В дальнейшем возможна смена кедровника на древостой с преобладанием тиса остроконечного. Такой ход развития сообществ для Дальнего Востока совершенно необычен.