Узагальнена оцінка проводиться експертною комісією (експертом) на заключному етапі експертизи. На основі проведеної перевірки заходів по забезпеченню екологічної безпеки, охорони навколишнього середовища, використання і відновлення природних ресурсів вони дають з урахуванням окремих оцінок інтегрований висновок по експертованому об'єкту. Така узагальнююча оцінка відображається в спеціальному юридичному документі — висновку екологічної експертизи. Це обгрунтована основа для прийняття рішення компетентними державними органами про можливість чи неможливість реалізації експертованого об'єкта в тих чи інших природно-соціальних умовах.
Можна констатувати, що процедура екологічної експертизи виконує важливу дисциплінуючу, методичну і юридичну роль в плані правильного і своєчасного проведення експертизи, реалізації прав і обов'язків суб'єктів еколого-експертних відносин. Процедура експертизи може розглядатися як необхідна, незамінна організаційно-правова гарантія незалежності екологічної експертизи від втручання будь-яких органів та осіб і як засіб гарантування екологічної безпеки. Питання процедури екологічної експертизи потребують негайної правової регламентації, зокрема в нормах спеціального розділу пропонованого Закону про екологічну експертизу з наступною конкретизацією в Методичних вказівках про порядок проведення екологічної експертизи (стосовно конкретних об'єктів).