В 1879 году границы города проходили на юге уже по правому берегу р.Белой, на склонах которого выделялись слободы Золотуха, Труниловка и Архиерейка. На западе граница застройки - по улице Никольской, отделенной от слободы Нижегородка незастроенным пространством; на севере - по ул.Богородской; на востоке - по Большой Сибирской улице (ныне ул.Мингажева); К востоку от р.Сутолоки граница шла севернее ул.Копейкина (ныне ул.Сун Ятсена) до кладбища и от него на юг до слободы Золотуха.
Дальнейший рост города связан с железнодорожным строительством. В короткий срок было застроено свободное пространство между Никольской улицей и железнодорожной линией от мусульманского кладбища до товарной станции. К северу от Богородской улицы появились Лазаретная и Сафроновская слободы, Малая Бекетовская улица (ныне ул.Белякова), на восточной окраине возникла Малая Сибирская улица (ныне ул.Ветошникова). За 40 лет, с 1864 по 1904 год, заселенная площадь города выросла в 1,7 раза.
Домовладения в Уфе сохраняли черты усадебного быта. Город был застроен небольшими деревянными одноэтажными домами, но в центре встречались двухэтажные и трехэтажные здания. По данным середины 80-х годов деревянные жилые дома составляли 93%, каменные и смешанные - 7%. В архитектурном отношении для Уфы того времени характерен деревянный особняк, в большинстве случаев с тремя окнами на улицу, с удлиненным дворовым фасадом в средней части и обязательно с мезонином. На выступах мезонина имелись крытые терассы с фронтоном. Парадные двери устраивались в виде лоджии с прочным деревянным перекрытием.
На общем фоне выделялись своими размерами и архитектурным оформлением казенные и общественные здания: здание Магометанского духовного управления (1863г.), (ныне помещение Отдела физики и математики Академии Наук, ул.Тукаева,50), здание городского Полицейского Управления и городской пожарной охраны (ныне Управление пожарной охраны МВД РБ, ул.Октябрьской революции, 14), Железнодорожный вокзал (старое здание), Почтамт (ныне телеграф, ул.Чернышевского, 61).
Центральной считалась Большая Казанская улица, соединявшая старую часть города с центром его новой части. В 90-х годах большое значение стали приобретать улицы, соединявшие город с железнодорожным вокзалом и Сафроновской пристанью: Лазаретная, переименованная в Центральную (ныне ул.Ленина), Александровская, Каретная (ныне ул.Аксакова). Большое движение проходило по Большой Вавиловской улице (ныне ул.Пушкина).
В центре новой части города находилась Верхне-Торговая площадь, занимавшая более 15 десятин. "В площадь, - писал народник С.Я.Елпатьевский, отбывавший в первой половине 80-х годов ссылку в Уфе и Благовещенском заводе, - вливались почти все улицы, а кругом площади разместилась вся уфимская цивилизация - тянулись длинные ряды, стояли дома, даже в три этажа, тут была и почта, и аптека, и палаты, и Дворянское собрание, и "Гранд-отель" с нумерами. Красовалась вывеска "Дамская портная", а обвитый сеном обруч и без вывески говорил понятливым людям, что здесь постоялый двор".
Городское хозяйство
Во второй половине XIX века, как и ранее, острейшей проблемой для Уфы было снабжение населения питьевой водой. В 1875 году городская Дума обратилась к предпринимателям с предложением построить на свои средства водопровод с подъемом воды из Белой, получая прибыли от его эксплуатации в течение 50 лет. Но желающих не нашлось. Тогда дума учредила особый фонд для строительства городского водопровода. К 1879 году удалось собрать 11 тыс. рублей, что было недостаточно.
В 1898 году Уфимская дума обратилась к правительству с просьбой разрешить ей выпуск облигационного займа на 300 тысяч рублей сроком на 37 лет из расчета 5% годовых. В июне того же года разрешение было получено. Средства от реализации займа полностью прежназначались на строительство водопровода. Наконец, в 1901 году была сдана в эксплуатацию первая очередь водопровода, обслуживающая центральную часть города.
1 февраля 1898 года начала давать ток первая электрическая станция, построенная на свои средства горным инженером Н.В.Коншиным. Основными потребителями электроэнергии были семьи богачей, казенные и общественные учреждения, промышленные и торговые заведения. Центральные улицы освещались 50 дуговыми фонарями.
Промышленность
Утверждение капиталистического способа производства в России в целом ускорило развитие промышленности в Уфе второй половины XIX века. В 60-70-х годах в промышленности города продолжало господствовать мелкое производство, основанное на ручном труде. В то же время появились первые предприятия мануфактурного типа в деревообделочной и силикатной промышленности, в которых из-за трудоемкости и сезонности производственного процесса требовалась значительная концентрация рабочей силы.
В 80-е годы начинается механизация промышленного производства, на лесопильных заводах купцов Ф.С.Стуколкина и П.С.Чикова появляются первые паровые двигатели.
Развитие отдельных отраслей промышленности Уфы происходит неравномерно. К 1890 году перестали существовать текстильное и химическое предприятия, переживали упадок силикатные, дерево-обделочные и жиро-восковые. С другой стороны, быстрыми темпами росла пищевая промышленность, объем производства которой с 1861 года увеличился в 10 раз.
Промышленный подъем 90-х годов вызвал бурное развитие фабрично-заводского производства в Уфе. С 1890 по 1900 год численность рабочих в фабрисной промышденности увеличилась в 3 раза, годовой объем производства - в 3,7 раза. Доля промышленных предприятий, имевших не менее 16 рабочих, составляла 82%.
Пароходное сообщение по реке Белой
В 1857-1858 годах по ходатайству местных промышленников было произведено обследование реки Белой. Комиссия нашла ее удобной для судоходства от устья до г.Стерлитамака и начала переговоры с параходными обществами Нижнего Новгорода об открытии на Белой пароходства.
11 августа 1858 года к Уфе подошли пароходы "Грозный" и "Быстрый", а 7 сентября - легкий пароход "Русалка", который поднялся по Белой на 12 верст выше устья р.Нугуш. В январе 1860 года правление нижегородского общества "Дружина" учредило в Уфе контору для организации пароходного сообщения, но неизученность фарватера реки, отсутствие благоустроенных пристаней сильно затрудняли сообщение, поэтому общество вскоре закрыло контору. С 1863 года по Белой курсировал лишь буксирный пароход "Надежда" уфимского купца Сафронова, а с 1867 года - пароход "Манатура" помещика Базилевского.
Только с учреждением в 1870 году общества "Бельское пароходство" на Белой установилось регулярное пароходное сообщение. Уже в 1871 годусовершали рейсы 5 пассажирских судов, из них 3 между Уфой и Казанью, 2 - между Уфой и Нижним Новгородом. Появились буксирные пароходы. К концу XIX века по Белой курсировало 57 товаро-пассажирских пароходов. Уфа стала центром Бельского речного пути и крупной пристанью.
Развитие железнодорожного сообщения
Строительство Самаро-Златустовской железной дороги сыграло огромную роль в подъеме экономической и культурной жихни Уфы. Общественность города, городское управление более 10 лет добивалось проведения Сибирской железной дороги через Уфу. 9 января 1885 года правительство утвердило проект железной дороги Самара - Уфа - Златоуст -Челябинск - Екатеринбург.
23 октября 1885 года начались строительные работы на Самаро-Уфимском участке дороги. Торжественная закладка вокзала и других железнодорожных сооружение в Уфе состоялась 26 апреля 1886 года. Строительство велось высокими темпами. Движение на Самаро-Уфимском участке открылось 8 сентября 1888 года. В этот день строители передали железнодорожникам мост через р.Белую. А ровно через два года, 8 сентября 1890 года, были приняты в эксплуатацию Уфимско-Златоустовский участок дороги и мост через р.Уфу.
На строительстве Уфимско-Златоустовского участка дороги инженером-изыскателем работал писатель Н.Г.Гарин-Михайловский. В своих произведениях (заключительная часть известной тетралогии "Инженеры", рассказ "Вариант" и др.) он использовал эпизоды и опыт этой своей деятельности, неоднократно бывал в Уфе по делам службы.
В августе 1888 года в Уфе вступили в строй главные мастерские Самаро-Златоустовской железной дороги (ныне Тепловозоремонтный завод) и депо. Мастерские состояли из трех отдельных зданий, в которых размещалось 5 цехов и 4 отделения. В 1889 году в них трудилось 167 рабочих, в дальнейшем их число резко возросло. В 1890 году мастерские были оснащены передовой по тому времени техникой и производили работы по капитальному ремонту и сборке паровозов, вагонов и котлов.
Население Уфы
| Годы | Количество жителей |
| 1864 1886 1897 | 20149 26976 49275 |
Население города росло высокими темпами. Как видно из таблицы, за 33 года его численности увеличилась в 2,5 раза. В основном население пополнялось за счет переселенцев из других мест. К концу XIX века Уфа становится многонациональным городом, хотя русское население остается безусловно преобладающим. В 1897 году русские, украинцы и белорусы составляют 85,36% населения Уфы, остальное - башкиры, татары и другие народности.
Управление городом
На основе нового городового положения, утвержденного Александром II в 1870 году, была проведена реформа городского самоуправления. Выборы по новому положению в Уфе состоялись с 25 ноября по 16 декабря 1870 года. Избиратели были разделены на 3 отдельные курии (собрания). Первая курия состояла из крупнейших собственников, уплачивающих треть общей суммы городских налогов (31 человек). Ко второй курии относились владельцы средних состояний, таже совместно вносивших треть поступающих с избирателей налогов (118 человек). К третьей курии относилось все остальное население, имевшее избирательное право (1126 человек). Они избрали 69 гласных городской думы, по 23 от каждой курии. В думе первого созыва заседали 40 купцов и почетных граждан, 17 дворян и чиновников, 1 представитель духовенства и 11 мещан и крестьян. Дума выделила городскую управу в составе городского головы, трех членов и секретаря.