В составе монархии Габсбургов могущество католической церкви достигло наибольших размеров. Некатолики удержались в Чехии только в отдаленных лесных районах и на границах с протестантскими государствами. Только 13 октября 1781 г. патент о веротерпимости разрешил переход в евангелическую веру и православие, но католическая церковь продолжала оставаться государственной.
Словакия.
Словацкая церковь находилась под юрисдикцией Эстергомского архиепископства. В 11 в. появляется целый ряд монастырей, ставших крупными земельными собственниками. В середине 15в. вместе с чешским католиком Яном Искрой из Брандеса пришло несколько тысяч гуситских воинов. В Словакии существовало течении братриков (последователи таборитов). Они были достаточно влиятельны и во второй половине 15в. даже приняли участие в династической борьбе. В 20х гг. 16 в. по Словакии прокатился ряд социальных выступлений, участники которых заявляли о себе как о последователях идей плебейской реформации. Широкий отклик в Словакии получили идеи лютеранства. Борьба за сословные привилегии, свободу вероисповедания создавала благоприятную почву для распространения реформационных идей.