Помимо этого, существовала еще одна процедура, позволявшая поднимать вопрос о правах меньшинств на заседаниях Совета Лига. В соответствии со статьей II Устава Лига Наций каждый член Лига имел право обратиться в Совет Лига с вопросом, имеющим международное значение и важным для сохранения мира между народами.
Таким образом, существовало, по меньшей мере три процедуры рассмотрения проблемы меньшинств в зависимости от статуса подателя для государств-членов Совета Лиги, для государств-членов Лиги и для государств, не являющихся членами Лиги, или представителей национальных меньшинств, на которых распространялись гарантии Лиги.
Порядок подачи и рассмотрения петиций определялся в ряде резолюций Совета и Ассамблеи Лиги Наций (резолюции Совета от 27 июня 1921 года, 5 сентября 1923 года, 8 сентября 1928 года, 13 июня 1929 года и резолюция VI Ассамблеи от 26 сентября 1923 года) [Stone 1932].
Согласно первой из этих резолюций все петиции за исключением поступающих от государств-членов Лига, должны быть направлены сначала государству, на действия которого поступала жалоба. Государству предоставлялся трехнедельный срок для извещения Генерального Секретаря Лиги о том, намеревается ли государство предоставить комментарии относительно жалобы. В соответствии с резолюцией Ассамблеи в случае отрицательного ответа государства петиция направлялась всем членам Лиги Если государство намеревалось предоставить комментарии, ему предоставлялся двухмесячный срок. Согласно резолюции от 5 сентября 1923 года, этот срок мог быть продлен в исключительных случаях Председателем Совета Лиги еще на два месяца.
Все петиции подавались на имя Генерального Секретаря Лиги, который первым определял приемлемость данной петиции. В том случае, когда генеральный Секретарь считал ситуацию чрезвычайной, он имел право ознакомить с содержанием петиции всех членов Совета Лиги, не дожидаясь ответа заинтересованного государства. В других случаях петиция поступала всем членам Лига вместе с полученными от государства комментариями.
Условия приемлемости петиции подробно раскрывались в резолюции Совета Лиги Наций от 5 сентября 1923 года, которая официально закрепляла принятый порядок рассмотрения петиций. В соответствии с этой резолюцией петиции о национальных меньшинствах:
А) должны быть направлены на защиту национальных меньшинств в соответствии с существовавшими соглашениями о национальных меньшинствах;
Б) не должны были подаваться в форме требования о разрыве политических отношений между национальным меньшинством и государством составной частью которого оно являлось;
В) не должны были исходить из анонимного или недостоверного источника;
Г) должны быть составлены в неоскорбительных выражениях;
Д) должны были содержать такую информацию или указывать на такие факты, которые за последнее время не были предметом какой-либо петиции, подвергавшейся обычной процедуре.
В случае невыполнения этих условий петиция считалась неприемлемой Секретариатом Лига и не подлежала рассмотрению [Блищенко, Абашидзе 1993:29].
Условие, указанное в пункте Б было предложено Польшей и Чехословакией, странами, имевшими наибольшую долю национальных меньшинств в населении, на XIII сессии Совета Лига Наций. Условие было направлено против сепаратистских устремлений и возможного раскола страны, однако оно не учитывало такой ситуации, когда меньшинство не имело политических отношений с правительством страны по вине последнего.
Резолюция Совета Лига от 13 июня 1929 года определяла порядок извещения подателя петиции, в соответствии с которым на Секретариат Лига возлагалась обязанность извещать заявителя жалобы о неприемлемости его петиции и о необходимых условиях, при которых она будет признана приемлемой. Секретариат, однако, не был обязан указывать на причину отказа в рассмотрении петиции или ее неприемлемости.
В структуре Секретариата Был создан Отдел Меньшинств, в обязанности которого входили контроль за соблюдением подачи петиции, составление докладов о работе Совета Лига по вопросам меньшинств, сбор материалов по поводу жалоб, перечисленных в петициях, переговоры с представителями правительств и контроль за соблюдением договоров о национальных меньшинствах.
Подлинным органом контроля за соблюдением Договоров о меньшинствах в Лиге Наций являлся, однако, не Отдел Меньшинств во главе с его Директором, но так называемый "Комитет Трех", рассматривавший основные положения петиции и правительственные замечания, а также включаемые в меморандумы материалы о фактических обстоятельствах дела, включая информацию о соответствующем законодательстве и т.п. Меморандумы для Комитетов Трех подготавливались в Отделе меньшинств. Создание adhoc комитетов предусматривалось Резолюцией Совета Лиги от 25 октября 1920 года. В Комитет входил Председатель Совета Лиги, выступающий как Председатель Комитета. Им же назначались два члена Совета в качестве помощников Председателя Комитета. В исключительных случаях число членов Комитета могло быть доведено до четырех.
Резолюция от 10 июня 1925 года устанавливала правила подбора членов Комитета для обеспечения максимальной беспристрастности. Членами Комитета не могли быть представители заинтересованных государств, а так же соседних государств, в которых большинство населения было той же национальности, что и указываемое в петиции меньшинство. В случае, если Председатель Совета Лиги подпадал под какую-либо из указанных категорий, Комитет возглавлял его заместитель по Совету Лиги, который и назначал двух других членов Комитета. Смена Председателя Совета Лиги не вызывала замену Председателя Комитета, если представляемое им государство не выбывало из Совета Лиги (в противном случае полномочия Председателя Комитета с него слагались).
На основе Резолюции Ассамблеи Лиги Наций от 21 сентября 1922 года Отдел Меньшинств составил Памятку для членов Комитета. Согласно ей члены Комитета имели право определять какие именно случаи следовало включать в повестку дня заседаний Совета Лиги в соответствии со статьей договоров о меньшинствах.
В полномочия Комитета входили проверка информации, содержащейся в петиции и замечаниях государства (в этом ему оказывалась помощь Секретарем Лиги); право запросить заинтересованное государство о дополнительной информации; право решать вопрос, имелся ли факт нарушения или опасность нарушения договорных обязательств. При наличии факта нарушения обязательств Комитет имел право начать неофициальные переговоры с заинтересованным государством для исправления положения При отказе государства от сотрудничества Комитет имел право подняв этот вопрос на Совете Лиги Наций, а также публиковать документы, относящиеся к данному вопросу (решение о публикации мог принять один, или все члены Комитета). Комитет имел право прекращать дело, если заинтересованное государство соглашалось на предложения Комитета об исправлении положения. Дело также прекращалось в том случае, если Комитет считал, что факт нарушения или опасности нарушения договорных обязательств отсутствует. В обоих случаях о прекращении дела извещались все члены Совета Лиги, для принятия решения по делу Комитет имел право запросить соответствующее правительство о предоставлении дополнительной информации через Отдел Меньшинств Секретариата. В некоторых случаях информация могла доводиться до сведения членов Комитета в устной форме. Предложения по делу, сформулированные сотрудниками Отдела Меньшинств принимались только в случае соответствующего запроса от Комитета. Заявителю петиции не предоставлялось права делать какие-либо официальные заявления; он так же не привлекался для предоставления дополнительной информации [UNDoc.E/CN.4/Sub.2/6:29].
Следует отметить, что хотя теоретически вопрос о правах меньшинств мог быть поставлен на рассмотрение Совета Лиги одним или несколькими ее членами (включая входивших в Комитет Трех) на любой стадии процедуры и независимо от его рассмотрения в Комитете Трех (а также до начала любых процедур по этому вопросу и при отсутствии петиции), на практике вопросы на повестку дня сессии обычно ставили Комитеты Трех в их полном составе.
Основной целью рассмотрения вопроса на Комитете было определение целесообразности его внесения в повестку дня Совета Лиги. Любой из членов Комитета имел право осуществить эту прерогативу, независимо от мнения коллег. Комитет мог также предложить решить спор мирным путем через компромисс с заинтересованным правительством. Переговоры с правительствами обычно осуществлялись отделом Меньшинств. Система переговоров стала наиболее распространенным методом рассмотрения Советом Лиги жалоб национальных меньшинств. Таким образом, Комитет Трех превратился в особую инстанцию, осуществлявшую контроль за соблюдением прав национальных меньшинств; лишь Совет Лиги являлся по отношению к Комитету высшей инстанцией.
До вступления в силу Резолюции Лиги 1929 года переговоры обычно не становились достоянием гласности; с принятием Резолюции эта практика изменилась и результаты переговоров стали сообщаться всем членам Совета Лиги. С согласия заинтересованного правительства эта информация могла также быть опубликованной в журнале Лиги Наций [Блищенко, Абашидзе 1993:33].
В мае 1920 года на Римской сессии Совета Лиги были установлены процедуры слушания дел. Если по рекомендации Комитета Трех, или одного из членов Совета дело передавалось в Совет Лиги, то в соответствии с установленными процедурами оно проходило общие дебаты, затем рассматривалось в специальном докладе Докладчика по проблемам меньшинств (избираемого сроком на один год, в отличие от конкретного докладчика по каждому отдельному случаю), на следующей стадии осуществлялся запрос о предоставлении консультативного заключения со стороны Постоянной Палаты Международного Правосудия и лишь затем принималось решение.