Если же исследовать хроматин в составе ядер или в виде выделенных препаратов, но при поддержании определенной концентрации двухвалентных катионов (не ниже 1мМ), то можно видеть дискретность в составе фибрилл хроматина диаметром 30 нм: она состоит как бы из сближенных глобул того же размера — из нуклеомеров. В зарубежной литературе такие 30-нанометровые глобулы, иди нуклеомеры, получили название сверхбусин («супербиды») (см. рис. 57, в и 62). Обнаружено, что если в условиях, когда нуклеомерная структура фибрилл хроматина сохраняется, препараты хроматина подвергнуть нук-леазной обработке, то часть хроматина растворяется. При этом в раствор выходят частицы, имеющие размер около 30 нм, с коэффициентом седиментации, равным 45S, в растворах, содержащих 1 мМ магния. Если такие выделенные нуклеомеры обработать ЭДТА, удалить ионы магния, то они разворачиваются в нуклеосомные цепочки, содержащие 6—8 нук-леосом. Таким образом, в состав одного нуклеомера входит отрезок ДНК, соответствующий 1600 парам оснований, или 8 нуклеосомам.
Компактность нуклеомера зависит от концентрации ионов магния и наличия гистона HI. Негистоновые белки в конформационных превращениях нуклеомеров не участвуют.
Итак, основная фибрилла хроматина диаметром 30 нм представляет собой линейное чередование нуклеомеров вдоль компактизованной молекулы ДНК (см. рис. 62). Вероятно, гистоны HI, находясь в центральной зоне этой крупной частицы и взаимодействуя друг с другом, поддерживают ее целостность. В пользу этого говорят данные о кооперативном связывании гистонов HI в группе по 6—8 молекул.
Противоречие между соленоидной и нуклеомерной моделями упаковки нуклеосом в составе фибрилл хроматина может быть снято, если принять модель нерегулярного соленоида: число нуклеосом на виток спирали не является строго постоянной величиной, что может привести к чередованию участков с большим или меньшим числом нуклеосом на виток.
Нуклеомерный уровень укладки хроматина обеспечивает 40-кратное уплотнение ДНК, что важно не только для достижения целей ком-пактизации гигантских молекул ДНК. Компактизация ДНК в составе фибрилл хроматина диаметром 30 нм может налагать дополнительные функциональные ограничения. Так, обнаружено, что в составе фибриллы хроматина диаметром 30 нм ДНК становится практически недоступной для взаимодействия с таким ферментом, как метилаза ДНК. Кроме того, резко падает способность хроматина связываться с РНК-полимеразой и рядом регуляторных белков. Таким образом, второй уровень компактизации ДНК может играть роль фактора, инакти-вирующего гены.
В заключение необходимо еще раз напомнить, что как нуклеосомный, так и нуклеомерный (супербидный) уровни компактизации ДНК хроматина осуществляются за счет гистоновых белков, которые участвуют не только в образовании нуклеосом, но и в их кооперативном объединении в виде фибрилл ДНП, где ДНК претерпевает дополнительную сверхспирализацию. Все остальные уровни компактизации связаны с дальнейшим характером укладки фибрилл диаметром 30 нм в новые ком-пактизационные уровни, где ведущую роль играют негистоновые белки.