Система простейших
| Простейшие с организацией жгутиконосцев(Mastigophora) | |||
| ТИП МНОГОЖГУТИКОВЫЕ (Polymastigota) | |||
| Класс РЕТОРТОМОНАДОВЫЕ (Retortamonada) | |||
| Класс ДИПЛОМОНАДОВЫЕ (Diplomonada) | |||
| Класс ОКСИМОНАДОВЫЕ (Oxymonada) | |||
| Класс ПАРАБАЗАЛИЕВЫЕ (Parabasalea) | |||
| ТИП ЭВГЛЕНОЗОИ (Euglenozoa) | |||
| Класс ЭВГЛЕНОВЫЕ (Euglenida) | |||
| Класс КИНЕТОПЛАСТОВЫЕ (Kinetoplastida) | |||
| ТИП КРИПТОМОНАДЫ (Cryptomonada) | |||
| ТИП ЗОЛОТИСТЫЕ ЖГУТИКОНОСЦЫ (Chrysomonada) | |||
| ТИП ОПАЛИНОВЫЕ (Opalinomonada) | |||
| Класс ПРОТЕРОМОНАДЫ (Proteromonada) | |||
| Класс ОПАЛИНЫ (Opalinata) | |||
| ТИП САПРОЛЕГНИЕВЫЕ (Saprolegnioidea) | |||
| Класс ООМИЦЕТЫ (Oomycetes) | |||
| Класс ГИФОХИТРИДИОМИЦЕТЫ (Hyphochytridiomycetes) | |||
| ТИП ЛАБИРИНТУЛЕВЫЕ (Labyrinthulea) | |||
| ТИП ПАНЦИРНЫЕ ЖГУТИКОНОСЦЫ (Dinomonada) | |||
| ТИП ЗЕЛЕНЫЕ ЖГУТИКОНОСЦЫ (Chloromonada) | |||
| ТИП ВОРОТНИЧКОВЫЕ (Choanomonada) | |||
| ТИП ХИТРИДИЕВЫЕ (Chytridiomycota) | |||
| Простейшие с организацией корненожек (Rhizopoda) | |||
| ТИП ЛОБОЗНЫЕ (Lobosea) | |||
| Класс ГОЛЫЕ ЛОБОЗНЫЕ АМЕБЫ (Gymnamoeba) | |||
| Класс РАКОВИННЫЕ ЛОБОЗНЫЕ АМЕБЫ (Testacealobosea) | |||
| ТИП ГЕТЕРОЛОБОЗНЫЕ (Heterolobosae) | |||
| Класс ШИЗОПИРЕНИДЫ (Schizopyrenida) | |||
| Класс АКРАЗИЕВЫЕ (Acrasea) | |||
| ТИП АРХАМЕБЫ (Archamoeba) | |||
| ТИП МИЦЕТОЗОА (Mycetozoa) | |||
| Класс БЕЗРАКОВИННЫЕ ФИЛОЗНЫЕ АМЕБЫ (Aconchulofilosea) | |||
| Класс ПРОТОСТЕЛИЕВЫЕ (Protostelea) | |||
| Класс ДИКТИОСТЕЛИЕВЫЕ (Dictyostelea) | |||
| Класс НАСТОЯЩИЕ МИКСОМИЦЕТЫ (Eumycetozoa) | |||
| ТИП ЦЕРКОЗОА (Cercozoa) | |||
| Класс ЦЕРКОМОНАДЫ (Cercomonada) | |||
| Класс РАКОВИННЫЕ ФИЛОЗНЫЕ АМЕБЫ (Testaceafilosea) | |||
| Класс РЕТИКУЛОФИЛОЗНЫЕ (Reticulofilosea) | |||
| ТИП ФОРАМИНИФЕРЫ (Foraminifera) | |||
| Класс АСТРОРИЗОВЫЕ (Astrorhizata) | |||
| Класс СПИРИЛЛИНЕВЫЕ (Spirullinata) | |||
| Класс МИЛИОЛИЕВЫЕ (Miliolata) | |||
| Класс НОДОЗАРИЕВЫЕ (Nodosariata) | |||
| Класс РОТАЛИЕВЫЕ (Rotaliata) | |||
| Класс ГЛОБИГЕРИНОВЫЕ (Globigerinata) | |||
| ТИП КСЕНОФИОФОРЕИ (Xenophyophorea) | |||
| Лучистые простейшие (Actinopoda) | |||
| ТИП ЛУЧЕВИКИ (Radiolaria) | |||
| Класс ПОЛИЦИСТИНЕЕВЫЕ (Polycystinea) | |||
| Класс ФЕОДАРИЕВЫЕ (Phaeodaria) | |||
| ТИП АКАНТАРИИ (Acantharea) | |||
| ТИП ТАКСОПОДЫ (Taxopoda) | |||
| ТИП СОЛНЕЧНИКИ (Heliozoa) | |||
| Класс АКТИНОФРИИДЫ (Actinophryida) | |||
| Класс ДЕСМОТОРАЦИДЫ (Desmothoracida) | |||
| Класс ЦИЛИОФРИИДЫ (Ciliophryida) | |||
| Класс ЦЕНТРОХЕЛИДЫ (Centrochelida) | |||
| Альвеолятные простейшие (Alveolata) | |||
| ТИП АПИКОМПЛЕКСОВЫЕ (Apicomplexa) | |||
| ПОДТИП ПЕРКИНСООБРАЗНЫЕ (Perkinsemorpha) | |||
| Класс КОЛПОДЕЛЛИДЫ (Colpodellida) | |||
| Класс ПЕРКИНСОВЫЕ (Perkinsida) | |||
| ПОДТИП СПОРОВИКИ (Sporozoa) | |||
| Класс ГРЕГАРИНЫ (Gregarinina) | |||
| Класс КОКЦИДИЕОБРАЗНЫЕ (Coccidiomorpha) | |||
| Отряд Eimeriida | |||
| Отряд Haemosporidia | |||
| Отряд Piroplasmida | |||
| ТИП РЕСНИЧНЫЕ ИЛИ ИНФУЗОРИИ (Ciliophora) | |||
| Класс КАРИОРЕЛИКТОВЫЕ (Karyorelicta) | |||
| Класс РАЗНОРЕСНИЧНЫЕ (Heterotricha) | |||
| Класс СПИРАЛЬНОРЕСНИЧНЫЕ (Spirotricha) | |||
| Класс ЛИТОСТОМАТОВЫЕ (Lithostomata) | |||
| Класс ХОНОТРИХА (Chonotricha) | |||
| Класс СОСУЩИЕ (Suctoria) | |||
| Класс КОЛПОДОВЫЕ (Colpodida) | |||
| Класс ПРОСТОМОВЫЕ (Prostomata) | |||
| Класс ОЛИГОГИМЕНОФОРОВЫЕ (Oligogymenophorea) | |||
| Класс БЕЗРОТЫЕ (Astomata) | |||
| Отдельные группы простейших | |||
| ТИП МИКРОСПОРИДИИ (Microsporidia) | |||
| ТИП МИКСОСПОРИДИИ (Myxozoa | |||