В исследованной выборке 304 больных туберкулезом русских жителей г. Томска и Томской области проанализировано распределение генотипов и частот аллелей полиморфизма генов NRAMP1, IL12B, VDR, IL1B, IL1RN (табл. 10). Выявлено отклонение наблюдаемого распределения генотипов полиморфизма B/b гена VDR от ожидаемого при РХВ (χ2=6,95; р=0,008) за счет повышенной гетерозиготности (табл. 10). Учитывая неслучайный характер отбора индивидов в выборке, можно предположить наличие вероятного вклада гена VDR в патогенез туберкулеза. Для исследованных полиморфизмов генов NRAMP1, IL12B, IL1B, IL1RN в общей группе больных туберкулезом отклонение от РХВ не показано.
Известно, что у жителей Тувы больных туберкулезом выявлено отклонение от РХВ для полиморфизмов 1465-85G/A и D543N гена NRAMP1 за счет пониженного количества гетерозигот в обоих случаях и для полиморфизмов B/b и F/f гена VDR за счет повышенной гетерозиготности [Рудко А.А., 2004]. Таким образом, как для русских, так и для тувинцев, больных туберкулезом, характерно повышенное количество гетерозигот B/b гена VDR. Сравнение частот аллелей и генотипов у русских и тувинцев, больных туберкулезом, показало статистически значимые отличия для всех исследованных полиморфных маркеров (табл. 11). Максимальная степень отличий частот аллелей и генотипов показана для полиморфизма B/b гена VDR.
Таблица 10 Частоты аллелей и генотипов исследованных полиморфизмов у больных туберкулезом
| Ген | Поли-морфизм | Гено-типы | N.O. | N.E. | Частота аллеля | χ2(d.f.) | Hobs | Hexp | D |
| NRAMP1 | 469+14G/C | GGGCCC | 179946 | 183,0785,8610,07 | G=0,810 | 2,25(1) | 0,337 | 0,308 | +0,095 |
| D543N | DDDNNN | 263141 | 262,2315,540,23 | D=0,971 | 1,28 (1) | 0,050 | 0,056 | -0,099 | |
| 1465-85G/A | GGGAAA | 12612627 | 128,03121,9429,03 | G=0,677 | 0,25(1) | 0,452 | 0,437 | +0,033 | |
| 274C/T | CCCTTT | 16312214 | 167,82112,3718,81 | C=0,749 | 2,01 (1) | 0,408 | 0,376 | +0,086 | |
| IL12B | 1188A/C | AAACCC | 16210017 | 161,09101,8216,09 | A=0,760 | 0,05(1) | 0,358 | 0,365 | -0,018 |
| VDR | B/b | BBBbbb | 4916876 | 60,37145,2687,37 | b=0,546 | 6,95*(1) | 0,573 | 0,496 | +0,157 |
| F/f | FFFfff | 12413440 | 122,42137,1638,42 | F=0,641 | 0,12(1) | 0,450 | 0,460 | -0,023 | |
| IL1B | +3953A1/A2 | A1A1A1A2A2A2 | 16910824 | 165,21115,5720,22 | A10,741 | 1,16(1) | 0,359 | 0,384 | -0,066 |
| IL1RN | VNTR | A1A1A1A2A1A3A1A4A2A2A2A3другие | 1581001012541 | 152,43110,1611,530,4319,904,170,38 | A1=0,714A2=0,258A3=0,027 | 6,35(6) | 0,385 | 0,422 | -0,088 |
Примечание. Обозначения см. табл. 6
Таблица 11 Сравнение частот аллелей и генотипов у русских и тувинцев с ТБ
| Полимор-физм | Гено-типы | Частоты (%) | p | Ал-лели | Частоты | p | ||
| русские | тувинцы | русские | тувинцы | |||||
| NRAMP1 | ||||||||
| 469+14 G/C | GGGCCC | 179 (64,2)94 (33,7)6 (2,1) | 198 (85) 32 (13,7)3 (1,3) | 0,000 | G | 0,810 | 0,918 | 0,000 |
| D543N | DDDNNN | 263 (94,6)14 (5)1 (0,4) | 191 (80,9)39 (16,5)6 (2,6) | 0,000 | D | 0,971 | 0,892 | 0,000 |
| 1465-85G/A | GGGAAA | 126 (45,2)126 (45,2)27 (9,6) | 153 (65,7)63 (27)17 (7,3) | 0,000 | G | 0,677 | 0,794 | 0,000 |
| 274C/T | CCCTTT | 163 (54,5)122 (40,8)14 (4,7) | 190 (80,5)45 (19,1)1 (0,4) | 0,000 | C | 0,749 | 0,900 | 0,000 |
| IL12B | ||||||||
| 1188 A/C | AAACCC | 162 (58)100 (35,8)17 (6,2) | 90 (38,6)102 (43,8)41 (17,6) | 0,000 | A | 0,760 | 0,605 | 0,000 |
| VDR | ||||||||
| B/b | BBBbbb | 49 (16,7)168 (57,3)76 (26) | 3 (1,3)82 (35)149 (63,7) | 0,000 | b | 0,546 | 0,812 | 0,000 |
| F/f | FFFfff | 124 (41,6)134 (45)40 (13,4) | 125 (53,6)102 (43,8)6 (2,6) | 0,000 | F | 0,641 | 0,755 | 0,000 |
| IL1B | ||||||||
| +3953 A1/A2 | A1A1A1A2A2A2 | 169 (56,1)108 (35,9)24 (8) | 185 (79,1)47 (20)2 (0,9) | 0,000 | A1 | 0,741 | 0,891 | 0,000 |
Примечание. р – достигнутый уровень значимости при сравнении частот аллелей и генотипов
У русских с ТБ и здоровых по сравнению с жителями Тувы чаще наблюдали гомозиготный по аллелею В и гетерозиготный генотипы. Среди жителей г. Томска, больных туберкулезом, по сравнению с тувинцами статистически значимо чаще встретились аллели 469+14C, 1465-85A, 274T гена NRAMP1, f гена VDR, и +3953А2 гена IL1В, реже регистрировались аллели 543N гена NRAMP1 и 1188С гена IL12B. В целом можно отметить, что отличия в распределении генотипов и аллелей между русскими и тувинцами были идентичными у больных и здоровых: у русских с туберкулезом преобладали те же аллели генов, что и у здоровых.
При сравнении распределений генотипов и частот аллелей в выборках больных и здоровых лиц, живущих в г. Томске и Томской области, выявлены статистически значимые отличия для полиморфизма 274С/Т гена NRAMP1 и трех генов, принимающих участие в продукции интерлейкинов (табл. 12). Так, у больных туберкулезом статистически значимо чаще регистрировался гетерозиготный генотип 274С/Т гена NRAMP1 (OR=1,66, 95%CI:1,02–2,71; p=0,040). Лица, обладающие гомозиготным генотипом 274С/C чаще встречались среди здоровых (OR=0,54, 95%CI:0,33–0,87; р=0,010). Показаны отличия частот аллелей у больных и здоровых для полиморфизма +3953 А1/А2 гена IL1B (p=0,036) за счет повышения доли аллеля А2 у больных туберкулезом. В тоже время, не найдено отличий при сравнении распределения генотипов этого полиморфизма гена IL1В (табл. 12).
Различия по VNTR полиморфизму гена IL1RN в выборках больных и здоровых касались как частот аллелей, так и частот генотипов. Аллель А2 статистически значимо чаще встречался у пациентов с туберкулезом. При сравнении частот генотипов выявлено более высокое количество гетерозигот А1/А2 у больных туберкулезом по сравнению с контролем (OR=2,10, 95%CI:1,26–3,51, р=0,003) (табл. 12). В противоположность этому у африканцев гетерозиготы по аллелю А2 IL1RN статистически значимо реже встречались у больных туберкулезом, чем в контрольной группе [BellamyR., RuwendeC., 1998].
Найдена ассоциация полиморфизма 1188А/С гена IL12В с туберкулезом. Установлено, что распределение генотипов и частота аллелей в группах больных и здоровых различаются. В выборке больных статистически значимо чаще встречаются гомозиготы по аллелю 1188С (р=0,035). В данном случае вероятность заболеть туберкулезом обладателей гомозиготного генотипа 1188С/С значимо выше, чем у индивидов с гомозиготным генотипом 1188А/А и гетерозиготным (OR=8,31, 95%CI:1,15–169,30, р=0,030) (табл. 12). Несмотря на отклонение распределения генотипов от ожидаемого при РХВ полиморфизма B/b гена VDR у больных туберкулезом, не показано отличий между больными и здоровыми.
Диагноз туберкулеза устанавливается на основании наличия у больного характерных жалоб, эпидемиологического анамнеза, анамнеза заболевания, клинических симптомов, характерных изменений в общем анализе крови и рентгенологической картины. Однако только при обнаружении микобактерий туберкулеза (МБТ) в мокроте диагноз туберкулеза можно считать верифицированным [Рабухин А.Е.,1976].
Учитывая это, при дальнейшем анализе из общей группы больных была выделена выборка пациентов с бактериовыделением (МБТ+) (n=234). При сравнении распределения генотипов и частот аллелей в группах больных лабораторно подтвержденным туберкулезом и контрольной, найдены статистически значимые отличия для полиморфизма 274С/Т гена NRAMP1, аллельного варианта +3953 А1/А2 гена IL1B, VNTR полиморфизма гена IL1RN и полиморфизма 1188А/С IL12В (табл. 13). Частота аллеля 274Т гена NRAMP1 была выше в группе больных (р=0,009). Показана протективная роль генотипа 274С/С (OR=0,53, 95%CI: 0,32– 0,88, р=0,012).
Таблица 12 Статистические показатели для сравнения частот аллелей и генотипов у больных туберкулезом и здоровых
| Ген | Полимор-физм | Гено-типы | Сравнение | OR (95%CI) | |
| Генотиповр | Аллелейр | ||||
| NRAMP1 | 469+14G/C | GG GC CC | 0,393 | 0,229 | 0,74(0,46–1,18) 1,32 (0,83–2,13) 1,48 (0,27–10,77) |
| D543N | DD DN | 0,283 | 0,377 | 1,66 (0,70–3,88) 0,56 (0,24–1,34) | |
| 1465-85G/A | GG GA AA | 0,134 | 0,312 | 0,70 (0,45–1,08) 1,54 (0,99–2,41) 0,86 (0,42–1,76) | |
| 274C/T | CC CT TT | 0,009 | 0,020 | 0,54* (0,33–0,87) 1,66* (1,02–2,71) 2,80 (0,59–18,13) | |
| IL12B | 1188A/C | AA AC CC | 0,035 | 0,044 | 0,72 (0,45–1,13) 1,12 (0,70–1,78) 8,31* (1,15–169,30) |
| VDR | B/b | BB Bb bb | 0,925 | 0,791 | 0,94 (0,51–1,76) 0,96 (0,60–1,54) 1,10 (0,64–1,91) |
| F/f | FF Ff ff | 0,705 | 0,469 | 1,20 (0,75–1,93) 0,89 (0,57–1,41) 0,88 (0,46–1,69) | |
| IL1B | +3953A1/A2 | A1A1 A1A2 A2A2 | 0,108 | 0,036 | 0,70 (0,45–1,08) 1,21 (0,77–1,90) 2,32 (0,82–7,10) |
| IL1RN | VNTR | A1A1 A1A2 A2A2 | 0,030 | 0,023 | 0,57* (0,36–0,88) 2,10* (1,26–3,51) 0,97 (0,45–2,13) |
Примечание. р - достигнутый уровень значимости; OR – величина отношения шансов; (95%CI) - доверительный интервал для OR; * - р < 0,05
Таблица 13 Статистические показатели для сравнения частот аллелей и генотипов у больных лабораторно подтвержденным туберкулезом и здоровых
| Полимор-физм | Гено-тип | N | р | OR (95% СI) | Частота аллеля | р |
| NRAMP1 | ||||||
| 274С/Т | CC CT TT | 126 94 12 | 0,021 | 0,53* (0,32–0,88) 1,64* (0,99–2,73) 3,11 (0,64–20,47) | C=0,746 | 0,009 |
| IL12B | ||||||
| 1188 А/С | AA AC CC | 125 82 12 | 0,044 | 0,69 (0,43–1,11) 1,20 (0,74–1,94) 7,42* (0,99–154,58) | A=0,758 | 0,046 |
| IL1B | ||||||
| +3953 А1/А2 | A1A1 A1A2 A2A2 | 131 82 21 | 0,080 | 0,69 (0,44–1,09) 1,16 (0,73–1,87) 2,64 (0,91–8,21) | A1=0,735 | 0,036 |
| IL1RN | ||||||
| VNTR | A1A1 A1A2 A2A2 другие | 121 79 21 11 | 0,042 | 0,55* (0,35–0,87) 2,16* (1,28–3,68) 1,06 (0,48–2,38) - | А1=0,707 A2=0,267 A3=0,024 A4=0,002 | 0,029 |
Примечание. р - достигнутый уровень значимости; OR – величина отношения шансов; (95%CI) - доверительный интервал для OR; N – количество индивидов с определенным генотипом; *- p < 0,05